RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

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Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 C6orf50Q9HD87 102 aa18.79■□□□□ 0.6
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HCLS1-202ENST00000428394 C10orf71Q711Q0 1435 aa18.78■□□□□ 0.6
HCLS1-202ENST00000428394 BAG3O95817 575 aa18.78■□□□□ 0.6
HCLS1-202ENST00000428394 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
HCLS1-202ENST00000428394 TFAP4Q01664 338 aa18.78■□□□□ 0.6
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC63Q05C16 580 aa18.78■□□□□ 0.6
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HCLS1-202ENST00000428394 ERFEQ4G0M1 354 aa18.78■□□□□ 0.6
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HCLS1-202ENST00000428394 ALS2CR12Q96Q35 445 aa18.78■□□□□ 0.6
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HCLS1-202ENST00000428394 TMEM51Q9NW97 253 aa18.78■□□□□ 0.6
HCLS1-202ENST00000428394 KAT6BQ8WYB5 2073 aa18.78■□□□□ 0.6
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM49BA6NDI0 452 aa18.77■□□□□ 0.6
HCLS1-202ENST00000428394 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
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HCLS1-202ENST00000428394 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP18.76■□□□□ 0.59
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HCLS1-202ENST00000428394 NLRP3Q96P20 1036 aa18.76■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM60Q9H2L4 133 aa18.76■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 SH2D4AQ9H788 454 aa18.76■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 FAM204AQ9H8W3 233 aa18.76■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 RIC8AQ9NPQ8 531 aa18.76■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
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HCLS1-202ENST00000428394 SMIM22K7EJ46 135 aa18.75■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 OPA1O60313 960 aa18.75■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.75■□□□□ 0.59
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HCLS1-202ENST00000428394 INF2Q27J81 1249 aa18.75■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
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HCLS1-202ENST00000428394 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 PES1O00541 588 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 SYF2O95926 243 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 TSPY3P0CV98 308 aa18.74■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 TSPY8P0CW00 308 aa18.74■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 EPB41P11171 864 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
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HCLS1-202ENST00000428394 VWA3BQ502W6 1294 aa18.74■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 ALS2CLQ60I27 953 aa18.74■□□□□ 0.59
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HCLS1-202ENST00000428394 SV2BQ7L1I2 683 aa18.74■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP18.74■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 MKNK2Q9HBH9 465 aa18.74■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 LEMD3Q9Y2U8 911 aa18.74■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 BRWD3Q6RI45 1802 aa18.74■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 EP400Q96L91 3159 aa18.73■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 RASSF10A6NK89 507 aa18.73■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 PLCG2P16885 1265 aa18.73■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 NOVP48745 357 aa18.73■□□□□ 0.59
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM266Q2M3C6 531 aa18.73■□□□□ 0.59
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