RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MORC4Q8TE76 937 aa19.73■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KIF1BPQ96EK5 621 aa19.73■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXL18Q96ME1 805 aa19.73■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM232C9JQI7 657 aa19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DCXO43602 365 aa19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KPNA6O60684 536 aa19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALAS1P13196 640 aa19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KCNA5P22460 613 aa19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NBPF20Q3BBV1 942 aa19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLFN13Q68D06 897 aa19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GIMAP6Q6P9H5 292 aa19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPRED2Q7Z698 418 aa19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC155Q8N6L0 562 aa19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTMR4Q9NYA4 1195 aa19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYP39A1Q9NYL5 469 aa19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NOD1Q9Y239 953 aa19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAD50Q92878 1312 aa19.72■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa19.71■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERVK-21P61565 698 aa19.71■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WDR5P61964 334 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IKQ13123 557 aaPredicted RBP19.71■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM63BQ5T3F8 832 aa19.71■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CEP95Q96GE4 821 aa19.71■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WDR11Q9BZH6 1224 aa19.71■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BOLA2Q9H3K6 86 aa19.71■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUGCTQ9HAC7 445 aa19.71■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCN5AQ14524 2016 aa19.71■□□□□ 0.75
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCHNA4D1U4 455 aa19.7■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GRXCR2A6NFK2 248 aa19.7■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PARNO95453 639 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL9P15248 144 aa19.7■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP5JP18859 108 aa19.7■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STK11IPQ8N1F8 1099 aa19.7■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STAG1Q8WVM7 1258 aa19.7■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAD9AQ99638 391 aa19.7■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MINDY4BA8MYZ0 360 aa19.69■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR6J1Q8NGC5 347 aa19.69■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CAGE1Q8TC20 777 aa19.69■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AFAP1L1Q8TED9 768 aa19.69■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HAUS7Q99871 368 aa19.69■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM50BQ9Y247 325 aa19.69■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TANC1Q9C0D5 1861 aa19.69■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BRWD1Q9NSI6 2320 aa19.68■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POTEB3A0JP26 581 aa19.68■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP19.68■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLA2G6O60733 806 aa19.68■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POTEBQ6S5H4 581 aa19.68■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NSMFQ6X4W1 530 aa19.68■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GMCL1Q96IK5 515 aa19.68■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTNNA3Q9UI47 895 aa19.68■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTUS1Q9ULD2 1270 aa19.68■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EFCAB14O75071 495 aa19.67■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GJB5O95377 273 aa19.67■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC1A4P43007 532 aa19.67■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MUM1L1Q5H9M0 696 aa19.67■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNKSR3Q6P9H4 555 aa19.67■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP19.67■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CRBNQ96SW2 442 aa19.67■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRKAG3Q9UGI9 489 aa19.67■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MYH4Q9Y623 1939 aa19.66■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa19.66■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC01553A4QN01 128 aa19.66■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A6NJR5 290 aa19.66■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GSG1L2A8MUP6 293 aa19.66■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHGBP05060 677 aa19.66■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEK9Q8TD19 979 aa19.66■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MFSD14AQ96MC6 490 aa19.66■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP19.66■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSPY3P0CV98 308 aa19.65■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TSPY8P0CW00 308 aa19.65■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEFB103AP81534 67 aa19.65■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP2R5BQ15173 497 aa19.65■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTGISQ16647 500 aa19.65■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PTPROQ16827 1216 aa19.65■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa19.65■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP19.65■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NEDD1Q8NHV4 660 aa19.65■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCPG1Q9ULG6 757 aa19.65■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PLIN4Q96Q06 1357 aa19.65■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa19.64■□□□□ 0.74
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB11FIP3O75154 756 aa19.64■□□□□ 0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRDM1O75626 825 aa19.64■□□□□ 0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SELPP16109 830 aa19.64■□□□□ 0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC8DQ7L1W4 858 aa19.64■□□□□ 0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXO22Q8NEZ5 403 aa19.64■□□□□ 0.73
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms