RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391230.1

SNORD66.1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 66, humanhuman

BASIC

Gene SNORD66, Length 76 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD66.1-201ENST00000391230 MYH15Q9Y2K3 1946 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 POTECB2RU33 542 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 C19orf81C9J6K1 198 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 ADM5C9JUS6 153 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 PIK3CDO00329 1044 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 WDR46O15213 610 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 NEMFO60524 1076 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 FOSP01100 380 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 CYP3A4P08684 503 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 POLR2MP0CAP2 368 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 CIITAP33076 1130 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 UBA7P41226 1012 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZNF75DP51815 510 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 BACE1P56817 501 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 MAP3K9P80192 1104 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 PLCB2Q00722 1185 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 DPYDQ12882 1025 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 AP3B2Q13367 1082 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 MTMR2Q13614 643 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 CUL4BQ13620 913 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 MORC3Q14149 939 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 PDIA5Q14554 519 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 NCAPHQ15003 741 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 GPR162Q16538 588 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 CALCRLQ16602 461 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 RRAGBQ5VZM2 374 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 DPY19L2Q6NUT2 758 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 CABP7Q86V35 215 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 FCHSD1Q86WN1 690 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 CEP57L1Q8IYX8 460 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 IGSF22Q8N9C0 903 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZNF280CQ8ND82 737 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 SPATA20Q8TB22 786 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 CLEC4DQ8WXI8 215 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 LPAR1Q92633 364 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 SMARCE1Q969G3 411 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 HOOK2Q96ED9 719 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 PNMA5Q96PV4 448 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 MED15Q96RN5 788 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 WRNIP1Q96S55 665 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 SLF1Q9BQI6 1058 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 BLZF1Q9H2G9 400 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 PICK1Q9NRD5 415 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 CCDC39Q9UFE4 941 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa4.88□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 GLTPD2A6NH11 291 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 SMTNL1A8MU46 457 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 BECN2A8MW95 431 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 FAM86B1E9PN63 330 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 KLRC4O43908 158 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 ZBED4O75132 1171 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 FLOT1O75955 427 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 SMC2O95347 1197 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 CFBP00751 764 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 ICAM1P05362 532 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 FAM86B2P0C5J1 330 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 CD44P16070 742 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 VCAM1P19320 739 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 DSG3P32926 999 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 EPHX2P34913 555 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 SREBF1P36956 1147 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 TXLNAP40222 546 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 STAT6P42226 847 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 USP14P54578 494 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 HMGCS2P54868 508 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 ARHGAP4P98171 946 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 TRAF1Q13077 416 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 GRB10Q13322 594 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 ECM1Q16610 540 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 Q4G0T1 1027 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 MUM1L1Q5H9M0 696 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 MCTP2Q6DN12 878 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 MOXD1Q6UVY6 613 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 MOB2Q70IA6 237 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 KRT26Q7Z3Y9 468 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 PLA2G4DQ86XP0 818 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 SULF1Q8IWU6 871 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 CPXCR1Q8N123 301 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 AOPEPQ8N6M6 819 aa4.87□□□□□ -1.63
SNORD66.1-201ENST00000391230 TRIML1Q8N9V2 468 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms