RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316939.2

GADD45GIP1-201, Transcript of GADD45G interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GADD45GIP1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USH1GQ495M9 461 aa24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ISM2Q6H9L7 571 aa24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MOXD1Q6UVY6 613 aa24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CRYGNQ8WXF5 182 aa24.72■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 OPLAHO14841 1288 aa24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR46O15213 610 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDC25AP30304 524 aa24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STAT6P42226 847 aa24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AFMP43652 599 aa24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NCAPHQ15003 741 aa24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.7■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa24.7■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PP2D1A8MPX8 630 aa24.7■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP3A7P24462 503 aa24.7■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 EPS15P42566 896 aa24.7■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZNF75DP51815 510 aa24.7■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MBOAT7Q96N66 472 aa24.7■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CUEDC2Q9H467 287 aa24.7■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MAGEF1Q9HAY2 307 aa24.7■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GGA3Q9NZ52 723 aa24.7■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DACH1Q9UI36 760 aa24.7■■□□□ 1.55
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PDIA5Q14554 519 aa24.7■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TMEM266Q2M3C6 531 aa24.7■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 NAALADL2Q58DX5 795 aa24.7■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.7■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KIFC2Q96AC6 838 aa24.7■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TRIM5Q9C035 493 aa24.7■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 INPP5BP32019 993 aa24.69■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TECP42680 631 aa24.69■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CABP7Q86V35 215 aa24.69■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.69■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SCYL3Q8IZE3 742 aa24.69■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTRQ99707 1265 aa24.69■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RAB34Q9BZG1 259 aa24.69■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYL1P05976 194 aa24.68■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PTMAP06454 111 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CDC25BP30305 580 aa24.68■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TPM4P67936 248 aa24.68■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MYL5Q02045 173 aa24.68■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WDR18Q9BV38 432 aa24.68■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24.68■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SREBF1P36956 1147 aa24.67■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TXKP42681 527 aa24.67■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa24.67■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PARP14Q460N5 1801 aa24.67■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SSC5DA1L4H1 1573 aa24.67■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.67■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CLCN1P35523 988 aa24.67■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ARHGAP4P98171 946 aa24.67■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.67■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KBTBD4Q9NVX7 518 aa24.67■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RNF181Q9P0P0 153 aa24.67■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 USP14P54578 494 aa24.66■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.66■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HAS1Q92839 578 aa24.66■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ABCB11O95342 1321 aa24.66■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.65■■□□□ 1.548e-11■□□□□ 8.9
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SEMA3FQ13275 785 aa24.65■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LRWD1Q9UFC0 647 aa24.65■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PLCG1P19174 1290 aa24.65■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CCDC174Q6PII3 467 aa24.65■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 WRNIP1Q96S55 665 aa24.65■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SLF1Q9BQI6 1058 aa24.65■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 HSD3B7Q9H2F3 369 aa24.65■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.65■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KCNMB3Q9NPA1 279 aa24.65■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 UTRNP46939 3433 aa24.64■■□□□ 1.54
GADD45GIP1-201ENST00000316939 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa24.64■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CASP1P29466 404 aa24.64■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CIITAP33076 1130 aa24.64■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CALML4Q96GE6 196 aa24.64■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 RMND1Q9NWS8 449 aa24.64■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 ICAM1P05362 532 aa24.63■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CYP3A4P08684 503 aa24.63■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 MTMR2Q13614 643 aa24.63■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 CUL4BQ13620 913 aa24.63■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.63■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 Q4G0T1 1027 aa24.63■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 LDHDQ86WU2 507 aa24.63■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 STAMQ92783 540 aa24.63■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 KLRG1Q96E93 195 aa24.63■■□□□ 1.53
GADD45GIP1-201ENST00000316939 PICK1Q9NRD5 415 aa24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms