RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234347.9

PRTN3-201, Transcript of proteinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRTN3, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRTN3-201ENST00000234347 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.48■■□□□ 1.35
PRTN3-201ENST00000234347 COL20A1Q9P218 1284 aa23.48■■□□□ 1.35
PRTN3-201ENST00000234347 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
PRTN3-201ENST00000234347 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PRTN3-201ENST00000234347 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PRTN3-201ENST00000234347 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PRTN3-201ENST00000234347 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.47■■□□□ 1.35
PRTN3-201ENST00000234347 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PRTN3-201ENST00000234347 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.47■■□□□ 1.35
PRTN3-201ENST00000234347 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PRTN3-201ENST00000234347 PKN1Q16512 942 aa23.46■■□□□ 1.35
PRTN3-201ENST00000234347 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.46■■□□□ 1.35
PRTN3-201ENST00000234347 RGS22Q8NE09 1264 aa23.46■■□□□ 1.35
PRTN3-201ENST00000234347 GTF3C6Q969F1 213 aa23.46■■□□□ 1.35
PRTN3-201ENST00000234347 CPLX1O14810 134 aa23.45■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 CTDNEP1O95476 244 aa23.45■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 CFBP00751 764 aa23.45■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 HSD17B4P51659 736 aa23.45■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 GHRHRQ02643 423 aa23.45■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 TRAF1Q13077 416 aa23.45■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.45■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 TINF2Q9BSI4 451 aa23.45■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.45■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.45■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 MCM3APO60318 1980 aa23.44■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 STXBP3O00186 592 aa23.44■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.44■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 TRPV1Q8NER1 839 aa23.44■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 UNC93B1Q9H1C4 597 aa23.44■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 SCG2P13521 617 aa23.43■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 UBXN2AP68543 259 aa23.43■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.43■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.43■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 SHISA4Q96DD7 197 aa23.43■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 ST18O60284 1047 aa23.42■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 CYBAP13498 195 aa23.42■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 CCL5P13501 91 aa23.42■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 NAPAP54920 295 aa23.42■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 ARMCX2Q7L311 632 aa23.42■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 TAAR1Q96RJ0 339 aa23.42■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 BARHL2Q9NY43 387 aa23.42■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.41■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 POLR2MP0CAP2 368 aa23.41■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 AIFM3Q96NN9 605 aa23.41■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 MAF1Q9H063 256 aa23.41■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 MEIS2O14770 477 aa23.4■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 PPP1R18Q6NYC8 613 aa23.4■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.4■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.4■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.4■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 RPTORQ8N122 1335 aa23.39■■□□□ 1.34
PRTN3-201ENST00000234347 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.39■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 hCG_1984214I3L0E3 225 aa23.39■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 JAK2O60674 1132 aa23.39■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 CDKL5O76039 1030 aa23.39■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 UBE2SQ16763 222 aa23.39■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.39■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 KATNBL1Q9H079 304 aa23.39■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 RNF208Q9H0X6 261 aa23.39■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.39■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 VPS54Q9P1Q0 977 aa23.39■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 STK36Q9NRP7 1315 aa23.38■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 ADAMTS3O15072 1205 aa23.38■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 DEXIO95424 95 aa23.38■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 EDNRBP24530 442 aa23.38■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 DNERQ8NFT8 737 aa23.38■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 MORC4Q8TE76 937 aa23.38■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 RMDN3Q96TC7 470 aa23.38■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 ASB14A6NK59 587 aa23.37■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 PIK3CDO00329 1044 aa23.37■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.37■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 PXMP2Q9NR77 195 aa23.37■■□□□ 1.33
PRTN3-201ENST00000234347 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms