RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000109698.8

Sh3bp1-204, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,923 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccdc38Q8CDN8 563 aa22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dcaf8Q8N7N5 591 aa22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Krt79Q8VED5 531 aa22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 F11Q91Y47 624 aa22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pagr1aQ99L02 253 aa22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pkd2l2Q9JLG4 621 aa22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 SisF8VQM5 1818 aa22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Becn1O88597 448 aa22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fgl2P12804 432 aa22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Camsap3Q80VC9 1252 aa22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Slc18a1Q8R090 521 aa22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ush1cQ9ES64 910 aa22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mkrn1Q9QXP6 481 aa22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tjp3Q9QXY1 905 aa22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lypla2Q9WTL7 231 aa22.51■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dcdc2bF7BCK0 340 aa22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pla2g4bP0C871 782 aa22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Garem2Q6PAJ3 880 aa22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Morc2bQ8C5W4 1022 aa22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mettl5Q8K1A0 209 aa22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Eps8l1Q8R5F8 716 aa22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Atp5c1Q91VR2 298 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nrbp1Q99J45 535 aa22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Q9DAQ4 598 aa22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tfr2Q9JKX3 798 aa22.5■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 L1camP11627 1260 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Bbs9Q811G0 885 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Asnsd1Q8BFS9 627 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dnaaf4Q8R368 420 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ushbp1Q8R370 680 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nr3c2Q8VII8 978 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 B3galt4Q9Z0F0 371 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cyp2j7A0A140T8U1 504 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mroh8E9PYI4 1049 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Rsph10bE9PYQ0 876 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Gm15448F6PZL4 682 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Akr1c19G3X9Y6 323 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Esr2O08537 530 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Adssl1P28650 457 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mns1Q61884 491 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ccdc148Q6P5U8 527 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Brd2Q7JJ13 798 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Spata21Q8BHW6 681 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tlcd1Q99JT6 247 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nap1l5Q9JJF0 156 aa22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Usp14Q9JMA1 493 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Bpifb4A2BGH0 617 aa22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Magea1O89006 320 aa22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Magea5O89009 320 aa22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ubxn2bQ0KL01 331 aa22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cep135Q6P5D4 1140 aa22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Fbxo28Q8BIG4 368 aa22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Trim9Q8C7M3 817 aa22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cmtm5Q9D6G9 156 aa22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dpp7Q9ET22 506 aa22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Magea2Q9R2A2 320 aa22.48■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 4932429P05RikA2ADI4 785 aa22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hoxa11P31311 313 aa22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nucb2P81117 420 aa22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Igf2bp2Q5SF07 592 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ano6Q6P9J9 911 aa22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kdm4bQ91VY5 1086 aa22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 CsadQ9DBE0 493 aa22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Uchl5Q9WUP7 329 aa22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Magi2Q9WVQ1 1275 aa22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sv2cQ69ZS6 727 aa22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 BaatQ91X34 420 aa22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Cfap45Q9D9U9 551 aa22.47■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Apol7aB2RT54 418 aa22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 AoahO35298 574 aa22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pcif1P59114 706 aa22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ift88Q61371 824 aa22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Hoxa13Q62424 386 aa22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Mss51Q9D5Z5 446 aa22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Sbf2E9PXF8 1872 aa22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ttc6G3UYY4 1857 aa22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Megf6Q80V70 1572 aa22.46■■□□□ 1.19
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 ThbdP15306 577 aa22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nlrp2Q4PLS0 1046 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Kif5bQ61768 963 aa22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Txndc16Q7TN22 820 aa22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Lmbrd1Q8K0B2 537 aa22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Washc1Q8VDD8 475 aa22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Aldh1b1Q9CZS1 519 aa22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Saal1Q9D2C2 474 aa22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Skint3A7TZF0 458 aa22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Zc3h7bF8VPP8 982 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Eif3j2Q66JS6 263 aa22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Krt39Q6IFX4 482 aa22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Taok2Q6ZQ29 1240 aa22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Dhx30Q99PU8 1217 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 PdhbQ9D051 359 aa22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Il21rQ9JHX3 529 aa22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Plcb1Q9Z1B3 1216 aa22.45■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Brca1P48754 1812 aa22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Ripor3A1L3T7 938 aa22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pak1O88643 545 aa22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Nol4P60954 483 aa22.44■■□□□ 1.18
Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 Pls1Q3V0K9 630 aa22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.8 ms