RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 SERPINB13Q9UIV8 391 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 FAM184BQ9ULE4 1060 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CPDO75976 1380 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 USP17L3A6NCW0 530 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 USP17L4A6NCW7 530 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 K7ENM7 598 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 HARSP12081 509 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ALAS1P13196 640 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PPM1EQ8WY54 764 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 MIS12Q9H081 205 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 RAB17Q9H0T7 212 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PKP1Q13835 747 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 HOMEZQ8IX15 550 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 RUNDC3BQ96NL0 473 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CLIC6Q96NY7 704 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CSRNP1Q96S65 589 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 RWDD2AQ9UIY3 292 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CCND2P30279 289 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF365Q70YC5 407 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 SEPT12Q8IYM1 358 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 AFAP1L1Q8TED9 768 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PLCD4Q9BRC7 762 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 MLXIPQ9HAP2 919 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 SAMD15Q9P1V8 674 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 MYO1AQ9UBC5 1043 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 AMFRQ9UKV5 643 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CAPN2P17655 700 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PPP2R5AQ15172 486 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 TYW1BQ6NUM6 668 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PEX26Q7Z412 305 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 SLF1Q9BQI6 1058 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 THAP9Q9H5L6 903 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 OSBPP22059 807 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 LIG4P49917 911 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 STAT2P52630 851 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 FOXO4P98177 505 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 BRD3Q15059 726 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 HLFQ16534 295 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 AOC3Q16853 763 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 FAM178BQ8IXR5 827 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 GRK7Q8WTQ7 553 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CDHR1Q96JP9 859 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CARD6Q9BX69 1037 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 HAUS4Q9H6D7 363 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 BCS1LQ9Y276 419 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 HYOU1Q9Y4L1 999 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 FAM169AQ9Y6X4 670 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 TNNC2P02585 160 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 SLFN14P0C7P3 912 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 BMP3P12645 472 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ALCAMQ13740 583 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 TFDP1Q14186 410 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 MAEAQ7L5Y9 396 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 TAOK1Q7L7X3 1001 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 SAR1BQ9Y6B6 198 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 DCCP43146 1447 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 XKR9Q5GH70 373 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 AP3B2Q13367 1082 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 LRCH2Q5VUJ6 765 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ATRIPQ8WXE1 791 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ATP6V0A1Q93050 837 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CD163L1Q9NR16 1453 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 EBAG9O00559 213 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PRKAB2O43741 272 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 CDK8P49336 464 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 PDE6CP51160 858 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 SEMA3FQ13275 785 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 ADAM9Q13443 819 aa7.12□□□□□ -1.27
PDE4D-228ENST00000636120 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.12□□□□□ -1.27
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