RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 PAK2Q13177 524 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 SPECC1Q5M775 1068 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC181Q5TID7 509 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 PI16Q6UXB8 463 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC31Q6UY01 552 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CD302Q8IX05 232 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 DNAJC10Q8IXB1 793 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 C10orf67Q8IYJ2 551 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 LCORLQ8N3X6 602 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 ACRBPQ8NEB7 543 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 RASSF8Q8NHQ8 419 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 WHAMMQ8TF30 809 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 P2RX5Q93086 422 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 SH3GL2Q99962 352 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 SELENOOQ9BVL4 669 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 TTYH3Q9C0H2 523 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 VPS16Q9H269 839 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 RIC8AQ9NPQ8 531 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 TAB2Q9NYJ8 693 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 VPS54Q9P1Q0 977 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 V9GY48 417 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 ROBO3Q96MS0 1386 aa8.61□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CACNA1SQ13698 1873 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 SYF2O95926 243 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 GNA11P29992 359 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 PRCPP42785 496 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 PPP2R5EQ16537 467 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CFAP221Q4G0U5 840 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 VWA3BQ502W6 1294 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 TTI2Q6NXR4 508 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CLEC4GQ6UXB4 293 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC91Q7Z6B0 441 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CROCCP2Q86T23 111 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC50Q8IVM0 306 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 OXER1Q8TDS5 423 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CALML4Q96GE6 196 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 TSG101Q99816 390 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 SENP2Q9HC62 589 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 STIM2Q9P246 746 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa8.6□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A087X0B3 334 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 ESYT2A0FGR8 921 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 GOLGA6L10A6NI86 522 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 BTNL10A8MVZ5 291 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 EVA1CP58658 441 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 HERVK_113P62684 666 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 LMNB2Q03252 620 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF174Q15697 407 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 NPY5RQ15761 445 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 CHRNA2Q15822 529 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 MAN2A1Q16706 1144 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 SPDYCQ5MJ68 293 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 LRIG3Q6UXM1 1119 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 USP49Q70CQ1 688 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 TEX2Q8IWB9 1127 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 NOX5Q96PH1 765 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 ANKRD2Q9GZV1 360 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 SH2D4AQ9H788 454 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 KAT14Q9H8E8 782 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 JADE2Q9NQC1 790 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 STK24Q9Y6E0 443 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 C10orf71Q711Q0 1435 aa8.59□□□□□ -1.03
CAPNS1-202ENST00000586851 MINDY4BA8MYZ0 360 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 ERLIN2O94905 339 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP2B1P20020 1258 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 GUCY2CP25092 1073 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 TNNC1P63316 161 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 GSTO1P78417 241 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 MTMR3Q13615 1198 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 CUL1Q13616 776 aa8.58□□□□□ -1.04
CAPNS1-202ENST00000586851 GRM4Q14833 912 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms