RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552296.6

PCBP2-222, Transcript of poly(rC) binding protein 2, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene PCBP2, Length 1,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP2-222	ENST00000552296	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	PLA2G6	O60733	806 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	FDX1	P10109	184 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	BMP3	P12645	472 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	CYP2C18	P33260	490 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	NOV	P48745	357 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TMEM199	Q8N511	208 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	MORC4	Q8TE76	937 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	GMCL1	Q96IK5	515 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	DCTPP1	Q9H773	170 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	ACAD9	Q9H845	621 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	IL23A	Q9NPF7	189 aa		10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TMEM232	C9JQI7	657 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	SMPD1	P17405	629 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	GNAT2	P19087	354 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TNFAIP2	Q03169	654 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	SLFN13	Q68D06	897 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	MYH6	P13533	1939 aa		10.61	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TNFRSF10A	O00220	468 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	B4GALT4	O60513	344 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	SLC4A3	P48751	1232 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TDO2	P48775	406 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	STAT2	P52630	851 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TLK2	Q86UE8	772 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	SPC25	Q9HBM1	224 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	RNF146	Q9NTX7	359 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		10.6	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	ASB14	A6NK59	587 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	GABBR2	O75899	941 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	CABYR	O75952	493 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TFAP4	Q01664	338 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	ITGA7	Q13683	1181 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TKFC	Q3LXA3	575 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	CCDC174	Q6PII3	467 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	FAM160B2	Q86V87	743 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	ASB2	Q96Q27	587 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	HIPK3	Q9H422	1215 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296		Q9Y3F1	56 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	LAMA4	Q16363	1823 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		10.59	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	NMT2	O60551	498 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	FGB	P02675	491 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	FGR	P09769	529 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TSPY3	P0CV98	308 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	TSPY8	P0CW00	308 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	MCC	P23508	829 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	SNAP25	P60880	206 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	PSMC6	P62333	389 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	PPARA	Q07869	468 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	RAB30	Q15771	203 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	KCTD1	Q719H9	257 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	INCENP	Q9NQS7	918 aa		10.58	□□□□□ -0.71
PCBP2-222	ENST00000552296	THEG	Q9P2T0	379 aa		10.58	□□□□□ -0.71

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