RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486708.1

SFI1-224, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 2

Gene SFI1, Length 651 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-224	ENST00000486708	EFCC1	Q9HA90	598 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	CBX8	Q9HC52	389 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	NAGPA	Q9UK23	515 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	C4A	P0C0L4	1744 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	USP27X	A6NNY8	438 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	NFKBIE	O00221	500 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	ZBTB39	O15060	712 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	TOMM70	O94826	608 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	FAM13A	O94988	1023 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	FURIN	P09958	794 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	SYT1	P21579	422 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	CDC25B	P30305	580 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	ARSD	P51689	593 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	PLAUR	Q03405	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	FSTL1	Q12841	308 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	GRIK4	Q16099	956 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	PROSER3	Q2NL68	480 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	JDP2	Q8WYK2	163 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	RILPL2	Q969X0	211 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	ASB16	Q96NS5	453 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	TRIM5	Q9C035	493 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	TNMD	Q9H2S6	317 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	TJP1	Q07157	1748 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	PTPRC	P08575	1304 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	CCDC69	A6NI79	296 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	PIK3R2	O00459	728 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	POLR3G	O15318	223 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	FZD6	O60353	706 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	XYLB	O75191	536 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	HMMR	O75330	724 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	ANXA1	P04083	346 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	RARA	P10276	462 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	NID1	P14543	1247 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	LIG1	P18858	919 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	CHML	P26374	656 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	GJB2	P29033	226 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	AK2	P54819	239 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	TPM4	P67936	248 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	GRAP	Q13588	217 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	CAMK4	Q16566	473 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	TEX35	Q5T0J7	233 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	TMC7	Q7Z402	723 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	FAM35A	Q86V20	835 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	ATCAY	Q86WG3	371 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	IL17RA	Q96F46	866 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	MEIS3	Q99687	375 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	STIM2	Q9P246	746 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SFI1-224	ENST00000486708	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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