RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371417.3

ARRDC1-AS1-201, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ARRDC1-AS1, Length 1,409 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SLC25A27O95847 323 aa25.23■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CCNA1P78396 465 aa25.23■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TKFCQ3LXA3 575 aa25.23■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SHISA4Q96DD7 197 aa25.23■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.23■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 HOMER2Q9NSB8 354 aa25.23■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 WBP1LQ9NX94 342 aa25.23■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.23■■□□□ 1.63
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BEGAINQ9BUH8 593 aa25.22■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PORCNQ9H237 461 aa25.22■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RNF146Q9NTX7 359 aa25.22■■□□□ 1.63
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PCNTO95613 3336 aa25.21■■□□□ 1.63
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CHST13Q8NET6 341 aa25.2■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MROH8Q9H579 483 aa25.2■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 EFCC1Q9HA90 598 aa25.2■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.2■■□□□ 1.63
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KIF3AQ9Y496 699 aa25.2■■□□□ 1.63
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ACAD9Q9H845 621 aa25.2■■□□□ 1.62
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CCDC148Q8NFR7 591 aa25.19■■□□□ 1.62
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SMCO2A6NFE2 343 aa25.18■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GPR25O00155 361 aa25.18■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 XBP1P17861 261 aa25.18■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 C8orf76Q96K31 380 aa25.18■■□□□ 1.62
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 SP3Q02447 781 aa25.17■■□□□ 1.62
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TBC1D5Q92609 795 aa25.17■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ZMYND12Q9H0C1 365 aa25.17■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25.17■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 NLRP5P59047 1200 aa25.16■■□□□ 1.62
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 TRIM29Q14134 588 aa25.15■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GPR142Q7Z601 462 aa25.15■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MCF2L2Q86YR7 1114 aa25.15■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa25.15■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 C6orf50Q9HD87 102 aa25.15■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.15■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CTGFP29279 349 aa25.14■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GNA11P29992 359 aa25.14■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ADCY7P51828 1080 aa25.14■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GUCY1B3Q02153 619 aa25.14■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GHRHRQ02643 423 aa25.14■■□□□ 1.62
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PLEKHH3Q7Z736 793 aa25.14■■□□□ 1.62
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CUL5Q93034 780 aa25.14■■□□□ 1.62
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CFBP00751 764 aa25.13■■□□□ 1.61
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RNF207Q6ZRF8 634 aa25.13■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.13■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MMP19Q99542 508 aa25.13■■□□□ 1.61
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ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PCDHA4Q9UN74 947 aa25.13■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MEIS2O14770 477 aa25.12■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 ADAMTS3O15072 1205 aa25.12■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 MMP1P03956 469 aa25.12■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 POLR2MP0CAP2 368 aa25.12■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 FCER1AP12319 257 aa25.12■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 PDCP20941 246 aa25.12■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 CALML3P27482 149 aa25.12■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 HSD17B4P51659 736 aa25.12■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 RPS6P62753 249 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 KCTD2Q14681 263 aa25.12■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 GALNT17Q6IS24 598 aa25.12■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.12■■□□□ 1.61
ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
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