RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 GAP43P17677 238 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 KCTD2Q14681 263 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC89Q8N998 374 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 TBC1D31Q96DN5 1066 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC93Q567U6 631 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 HYOU1Q9Y4L1 999 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 ABCC12Q96J65 1359 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 NPR1P16066 1061 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 IFNAR1P17181 557 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 PDE6CP51160 858 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 TFDP1Q14186 410 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 LONRF2Q1L5Z9 754 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 MICALL1Q8N3F8 863 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 LPXNO60711 386 aa20.84■□□□□ 0.93
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PTPRE-201ENST00000254667 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 CRCPO75575 148 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 GMNNO75496 209 aa20.84■□□□□ 0.93
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PTPRE-201ENST00000254667 ABCD1P33897 745 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 LIFRP42702 1097 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
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PTPRE-201ENST00000254667 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.83■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 KIAA1024Q9UPX6 916 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 ELF2Q15723 593 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 GRK7Q8WTQ7 553 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 CDHR1Q96JP9 859 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 COA1Q9GZY4 146 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 RAB20Q9NX57 234 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRE-201ENST00000254667 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
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PTPRE-201ENST00000254667 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.83■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.83■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 OSBP2Q969R2 916 aa20.83■□□□□ 0.92
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PTPRE-201ENST00000254667 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 TMEM191BP0C7N4 346 aa20.82■□□□□ 0.92
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PTPRE-201ENST00000254667 STK17AQ9UEE5 414 aa20.82■□□□□ 0.92
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PTPRE-201ENST00000254667 GEN1Q17RS7 908 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 CHD1O14646 1710 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 CLRN2A0PK11 232 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 MMP1P03956 469 aa20.82■□□□□ 0.92
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PTPRE-201ENST00000254667 BPIFB4P59827 614 aa20.82■□□□□ 0.92
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PTPRE-201ENST00000254667 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
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PTPRE-201ENST00000254667 HESX1Q9UBX0 185 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 P3H4Q92791 437 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 RPS6KA4O75676 772 aa20.81■□□□□ 0.92
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PTPRE-201ENST00000254667 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.81■□□□□ 0.92
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PTPRE-201ENST00000254667 H2AFVQ71UI9 128 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 RIC8AQ9NPQ8 531 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 GIPC1O14908 333 aa20.81■□□□□ 0.92
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PTPRE-201ENST00000254667 OSBPP22059 807 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 COPB1P53618 953 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 HHATQ5VTY9 493 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 SUSD4Q5VX71 490 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.81■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 LRRIQ4A6NIV6 560 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 NDUFAB1O14561 156 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 STAM2O75886 525 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 SARNPP82979 210 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 VPS52Q8N1B4 723 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 SASH1O94885 1247 aa20.8■□□□□ 0.92
PTPRE-201ENST00000254667 KIF11P52732 1056 aa20.8■□□□□ 0.92
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