RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

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Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 NCOA7Q8NI08 942 aa26.22■■□□□ 1.79
SYT6-210ENST00000641643 AGBL1Q96MI9 1066 aa26.22■■□□□ 1.79
SYT6-210ENST00000641643 ACAD9Q9H845 621 aa26.22■■□□□ 1.79
SYT6-210ENST00000641643 SNAP25P60880 206 aa26.21■■□□□ 1.79
SYT6-210ENST00000641643 ZNF792Q3KQV3 632 aa26.21■■□□□ 1.79
SYT6-210ENST00000641643 TKFCQ3LXA3 575 aa26.21■■□□□ 1.79
SYT6-210ENST00000641643 ANKLE1Q8NAG6 615 aa26.21■■□□□ 1.79
SYT6-210ENST00000641643 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.21■■□□□ 1.79
SYT6-210ENST00000641643 ZNF536O15090 1300 aa26.2■■□□□ 1.79
SYT6-210ENST00000641643 E7EWF7 191 aa26.2■■□□□ 1.79
SYT6-210ENST00000641643 MSCO60682 206 aa26.2■■□□□ 1.79
SYT6-210ENST00000641643 ALAS1P13196 640 aa26.2■■□□□ 1.79
SYT6-210ENST00000641643 RNF146Q9NTX7 359 aa26.2■■□□□ 1.79
SYT6-210ENST00000641643 OGDHLQ9ULD0 1010 aa26.2■■□□□ 1.79
SYT6-210ENST00000641643 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
SYT6-210ENST00000641643 ERICH2A1L162 156 aa26.2■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 TRERF1Q96PN7 1200 aa26.2■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 HTATIP2Q9BUP3 242 aa26.2■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 CCPG1Q9ULG6 757 aa26.2■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 CDC45O75419 566 aa26.19■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 IGHA2P01877 340 aa26.19■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 ICAM1P05362 532 aa26.19■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 CYBAP13498 195 aa26.19■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 SART3Q15020 963 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 TINF2Q9BSI4 451 aa26.19■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 CYB5R4Q7L1T6 521 aa26.18■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP26.18■■□□□ 1.78
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SYT6-210ENST00000641643 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa26.18■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
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SYT6-210ENST00000641643 LHX8Q68G74 356 aa26.17■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 DPF3Q92784 378 aa26.17■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 PNMA2Q9UL42 364 aa26.17■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 ASPRV1Q53RT3 343 aa26.16■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
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SYT6-210ENST00000641643 NRBP1Q9UHY1 535 aa26.16■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 CNPY2Q9Y2B0 182 aa26.16■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.16■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa26.16■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa26.16■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 STOX1Q6ZVD7 989 aa26.16■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 POTEB2H3BUK9 544 aa26.15■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 SEPT4O43236 478 aa26.15■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 SEC23AQ15436 765 aa26.15■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 UBA5Q9GZZ9 404 aa26.15■■□□□ 1.78
SYT6-210ENST00000641643 WTAPQ15007 396 aa26.14■■□□□ 1.78
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SYT6-210ENST00000641643 SLC27A2O14975 620 aa26.13■■□□□ 1.77
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SYT6-210ENST00000641643 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
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SYT6-210ENST00000641643 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
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SYT6-210ENST00000641643 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.12■■□□□ 1.77
SYT6-210ENST00000641643 C11orf49Q9H6J7 331 aa26.12■■□□□ 1.77
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SYT6-210ENST00000641643 MUM1L1Q5H9M0 696 aa26.12■■□□□ 1.77
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SYT6-210ENST00000641643 NSMFQ6X4W1 530 aa26.12■■□□□ 1.77
SYT6-210ENST00000641643 CPVLQ9H3G5 476 aa26.12■■□□□ 1.77
SYT6-210ENST00000641643 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa26.11■■□□□ 1.77
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SYT6-210ENST00000641643 MCM5P33992 734 aa26.09■■□□□ 1.77
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SYT6-210ENST00000641643 AKR1A1P14550 325 aa26.08■■□□□ 1.77
SYT6-210ENST00000641643 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
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SYT6-210ENST00000641643 MTA3Q9BTC8 594 aa26.08■■□□□ 1.77
SYT6-210ENST00000641643 CEP290O15078 2479 aa26.08■■□□□ 1.77
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SYT6-210ENST00000641643 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 USH1GQ495M9 461 aa26.07■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 ARMCX2Q7L311 632 aa26.07■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa26.07■■□□□ 1.76
SYT6-210ENST00000641643 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
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