RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566515.5

CCNDBP1-208, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 PTPREP23469 700 aa24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 RAET1EQ8TD07 263 aa24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 MYH6P13533 1939 aa24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 CENPFP49454 3210 aa24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 MORN1Q5T089 497 aa24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 APOA5Q6Q788 366 aa24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 BRF1Q92994 677 aa24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 APOBRQ0VD83 1088 aa24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 NBPF11Q86T75 865 aa24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 MICU3Q86XE3 530 aa24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP3K14Q99558 947 aa24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 ICAM1P05362 532 aa24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 CALM1P0DP23 149 aa24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 CALM2P0DP24 149 aa24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 CALM3P0DP25 149 aa24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 SOCS4Q8WXH5 440 aa24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCPG1Q9ULG6 757 aa24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 HPS5Q9UPZ3 1129 aa24.39■■□□□ 1.5
CCNDBP1-208ENST00000566515 STRNO43815 780 aa24.39■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 ALAS1P13196 640 aa24.39■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYP2B6P20813 491 aa24.39■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 COPB2P35606 906 aa24.39■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRB14Q14449 540 aa24.39■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 USP6NLQ92738 828 aa24.39■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 AGXT2Q9BYV1 514 aa24.39■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 FCER1AP12319 257 aa24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 KIF5BP33176 963 aa24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 IRF5Q13568 498 aa24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXL16Q8N461 479 aa24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 FANCBQ8NB91 859 aa24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 MMP19Q99542 508 aa24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB43O43298 467 aa24.37■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADCY3O60266 1144 aa24.37■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 ADORA2AP29274 412 aa24.37■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 MAP2K5Q13163 448 aa24.37■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.37■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 IL17RAQ96F46 866 aa24.37■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 TRERF1Q96PN7 1200 aa24.37■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 RNF146Q9NTX7 359 aa24.37■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.37■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 CYTH3O43739 400 aa24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 ELNP15502 786 aa24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 RGS2P41220 211 aa24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 CHST13Q8NET6 341 aa24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 RIOX1Q9H6W3 641 aa24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 KCTD2Q14681 263 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 USH1GQ495M9 461 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 MUM1L1Q5H9M0 696 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 COBLO75128 1261 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 GRK4P32298 578 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 TKFCQ3LXA3 575 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 DPP9Q86TI2 863 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 HOMER1Q86YM7 354 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 ABHD8Q96I13 439 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 ACAD9Q9H845 621 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXO40Q9UH90 709 aa24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOLGA8AA7E2F4 631 aa24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 PGK2P07205 417 aa24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 GNAQP50148 359 aa24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCL14Q16627 93 aa24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 MTMR8Q96EF0 704 aa24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 PIGSQ96S52 555 aa24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 APBA2Q99767 749 aa24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 RTN1Q16799 776 aa24.33■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 ANKRD35Q8N283 1001 aa24.33■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.33■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 SLAIN1Q8ND83 568 aa24.33■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.33■■□□□ 1.49
CCNDBP1-208ENST00000566515 ZBTB5O15062 677 aa24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1-208ENST00000566515 FBXO11Q86XK2 927 aa24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms