RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559396.5

DCAF11-222, Transcript of DDB1 and CUL4 associated factor 11, human

TSL 3

Gene DCAF11, Length 300 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DCAF11-222	ENST00000559396	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	POTEB2	H3BUK9	544 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	EBAG9	O00559	213 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	MYO1B	O43795	1136 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	PPFIA3	O75145	1194 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	PYGB	P11216	843 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	CYP11B2	P19099	503 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	RXRB	P28702	533 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	INPP5B	P32019	993 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	CLCN6	P51797	869 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	FOSB	P53539	338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	APOBR	Q0VD83	1088 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	MAP3K12	Q12852	859 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	CUL3	Q13618	768 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	UBE3C	Q15386	1083 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	SH2D4B	Q5SQS7	431 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	MSL1	Q68DK7	614 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	CHST3	Q7LGC8	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	VPS37D	Q86XT2	251 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	UBXN4	Q92575	508 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	TBC1D5	Q92609	795 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	BRF1	Q92994	677 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	AKT1S1	Q96B36	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	AIDA	Q96BJ3	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	MPP4	Q96JB8	637 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	KCND1	Q9NSA2	647 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	JAG2	Q9Y219	1238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	ITM2B	Q9Y287	266 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	ZMYM6	O95789	1325 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	NEDD4	P46934	1319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	XDH	P47989	1333 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	SYCE3	A1L190	88 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	ABLIM1	O14639	778 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	ZNF213	O14771	459 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	PRC1	O43663	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	KDM1A	O60341	852 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	JAK2	O60674	1132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	KIAA0754	O94854	1291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	UFL1	O94874	794 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	F13A1	P00488	732 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	PYGL	P06737	847 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	IDO1	P14902	403 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	CYP7A1	P22680	504 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	TM4SF1	P30408	202 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	GPSM2	P81274	684 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	DRP2	Q13474	957 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	CUL4B	Q13620	913 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	COL19A1	Q14993	1142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	E2F5	Q15329	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	PTPN14	Q15678	1187 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	ELF2	Q15723	593 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	CNGA3	Q16281	694 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	PKN1	Q16512	942 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396		Q4G0T1	1027 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	ISM2	Q6H9L7	571 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DCAF11-222	ENST00000559396	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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