RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504398.1

AC008825.1-201, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene AC008825.1, Length 452 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008825.1-201ENST00000504398 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 Q3C1V9 767 aa21.54■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 PARP14Q460N5 1801 aa21.54■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 ZBTB5O15062 677 aa21.53■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 ADD1P35611 737 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa21.53■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 FBXO40Q9UH90 709 aa21.53■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 CYTH3O43739 400 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 STRNO43815 780 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 IFNAR1P17181 557 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 CDC27P30260 824 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 PLS1Q14651 629 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 CPXCR1Q8N123 301 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 CHST13Q8NET6 341 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.52■■□□□ 1.04
AC008825.1-201ENST00000504398 ZNF536O15090 1300 aa21.52■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 CPLX1O14810 134 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 CDKL5O76039 1030 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 HOXD10P28358 340 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 FCGRTP55899 365 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 FUT2Q10981 343 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 NBPF11Q86T75 865 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 AMNQ9BXJ7 453 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 CPVLQ9H3G5 476 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 A0A0G2JMZ2 1700 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 NTRK3Q16288 839 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 ME3Q16798 604 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 SLC35G1Q2M3R5 365 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 FBXO11Q86XK2 927 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 ABRAQ8N0Z2 381 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 TSKSQ9UJT2 592 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 CCPG1Q9ULG6 757 aa21.5■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 ERCC3P19447 782 aa21.49■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 PSMC4P43686 418 aa21.49■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 PRMT2P55345 433 aa21.49■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 CCDC174Q6PII3 467 aa21.49■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 TEX2Q8IWB9 1127 aa21.49■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 COA7Q96BR5 231 aa21.49■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 AGBL1Q96MI9 1066 aa21.49■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 PIGSQ96S52 555 aa21.49■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 LBX1P52954 281 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 SCRN1Q12765 414 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 PLEKHH3Q7Z736 793 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 NCAPG2Q86XI2 1143 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 RGS22Q8NE09 1264 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 GTF3C6Q969F1 213 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 PORCNQ9H237 461 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 ABCB11O95342 1321 aa21.48■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 STK3Q13188 491 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 HOMER1Q86YM7 354 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 TRERF1Q96PN7 1200 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 ACAD9Q9H845 621 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 EFCC1Q9HA90 598 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 SLC15A5A6NIM6 579 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 PEX10O60683 326 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 FCER1AP12319 257 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 ALAS1P13196 640 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 SNAP25P60880 206 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 GPR142Q7Z601 462 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 SOCS4Q8WXH5 440 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 SNX21Q969T3 373 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 TRIM47Q96LD4 638 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008825.1-201ENST00000504398 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms