RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496793.1

ARRDC1-AS1-202, ARRDC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARRDC1-AS1, Length 1,424 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 TMEM106CQ9BVX2 250 aa28.68■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ASPRV1Q53RT3 343 aa28.67■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CATIPQ7Z7H3 387 aa28.67■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 HMGCRP04035 888 aa28.66■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 HOXC6P09630 235 aa28.66■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ELNP15502 786 aa28.66■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 TROAPQ12815 778 aa28.66■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa28.66■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ZNF654Q8IZM8 581 aa28.66■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 AGBL1Q96MI9 1066 aa28.66■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 PNMA2Q9UL42 364 aa28.66■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ZNF536O15090 1300 aa28.65■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 SMCHD1A6NHR9 2005 aa28.65■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CCDC69A6NI79 296 aa28.65■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CASTP20810 708 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 DPP9Q86TI2 863 aa28.65■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 TMTC2Q8N394 836 aa28.65■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 FBXO40Q9UH90 709 aa28.65■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 MAD2L2Q9UI95 211 aa28.65■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 RXRAP19793 462 aa28.64■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ADORA2AP29274 412 aa28.64■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 LIFRP42702 1097 aa28.64■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 KCTD2Q14681 263 aa28.64■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 GRM4Q14833 912 aa28.64■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP28.64■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 VAT1LQ9HCJ6 419 aa28.64■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 HOMER2Q9NSB8 354 aa28.64■■■□□ 2.18
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 WDR19Q8NEZ3 1342 aa28.64■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CHST13Q8NET6 341 aa28.63■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 MMP19Q99542 508 aa28.63■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ZNF236Q9UL36 1845 aa28.63■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 KLRF2D3W0D1 207 aa28.62■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 INHAP05111 366 aa28.62■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 RPS6KB1P23443 525 aa28.62■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 PSMA5P28066 241 aa28.62■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 TKFCQ3LXA3 575 aa28.62■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa28.62■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ADGRF4Q8IZF3 695 aa28.62■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 MYCP01106 439 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 FGD1P98174 961 aa28.61■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 Q6ZUG5 572 aa28.61■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 SLC12A7Q9Y666 1083 aa28.61■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 DDAH1O94760 285 aa28.6■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ALAS1P13196 640 aa28.6■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP28.6■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 TRIB2Q92519 343 aa28.6■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 BRPF3Q9ULD4 1205 aa28.6■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CCPG1Q9ULG6 757 aa28.6■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ICAM1P05362 532 aa28.6■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 SOX10P56693 466 aa28.6■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 SLC35G1Q2M3R5 365 aa28.6■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 SGMS1Q86VZ5 419 aa28.6■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa28.6■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CCL5P13501 91 aa28.59■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 MFSD14CQ5VZR4 134 aa28.59■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 MICU3Q86XE3 530 aa28.59■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 RNF208Q9H0X6 261 aa28.59■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 JMJD4Q9H9V9 463 aa28.59■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 RNF146Q9NTX7 359 aa28.59■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 COBLO75128 1261 aa28.58■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CCL14Q16627 93 aa28.58■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 RUFY3Q7L099 469 aa28.58■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 BRF1Q92994 677 aa28.58■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 DDX11Q96FC9 970 aa28.58■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ACAD9Q9H845 621 aa28.58■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa28.57■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 PGK2P07205 417 aa28.57■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CAPN2P17655 700 aa28.57■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 APOBRQ0VD83 1088 aa28.57■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 MTFR1Q15390 333 aa28.57■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 MUM1L1Q5H9M0 696 aa28.57■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 OLFML2BQ68BL8 750 aa28.57■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 APOA5Q6Q788 366 aa28.57■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 ANKRD35Q8N283 1001 aa28.57■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 NPLOC4Q8TAT6 608 aa28.57■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 TRERF1Q96PN7 1200 aa28.57■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 MAP3K14Q99558 947 aa28.57■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa28.57■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 RPTORQ8N122 1335 aa28.57■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 GJB1P08034 283 aa28.56■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 USH1GQ495M9 461 aa28.56■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.56■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 PIBF1Q8WXW3 757 aa28.56■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 TM6SF1Q9BZW5 370 aa28.56■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 MYH6P13533 1939 aa28.56■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 PLEKHA8P1O95397 391 aa28.55■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 RGS19P49795 217 aa28.55■■■□□ 2.16
ARRDC1-AS1-202ENST00000496793 TRIM32Q13049 653 aa28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms