RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 SPRYD7Q5W111 196 aa25.37■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 FBXO11Q86XK2 927 aa25.37■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 AMNQ9BXJ7 453 aa25.37■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.37■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 PHF20Q9BVI0 1012 aa25.37■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 ZBED4O75132 1171 aa25.36■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 CETPP11597 493 aa25.36■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 CALML3P27482 149 aa25.36■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 USH1GQ495M9 461 aa25.36■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 RGMBQ6NW40 437 aa25.36■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.36■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.36■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.36■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 TRAF1Q13077 416 aa25.35■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.35■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 SHISA4Q96DD7 197 aa25.35■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.35■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 FDX1P10109 184 aa25.34■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 DSG3P32926 999 aa25.34■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 KRT2P35908 639 aa25.34■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 TYW1BQ6NUM6 668 aa25.34■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 ATG4CQ96DT6 458 aa25.34■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 PTPRFP10586 1907 aa25.34■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.34■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 SMCO2A6NFE2 343 aa25.34■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 CCL15Q16663 113 aa25.34■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 C6orf50Q9HD87 102 aa25.34■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 BTBD18B2RXH4 712 aa25.33■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 GNA11P29992 359 aa25.33■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 CPXCR1Q8N123 301 aa25.33■■□□□ 1.65
PSPC1-204ENST00000492741 VWA5AO00534 786 aa25.32■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 OSBPP22059 807 aa25.32■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 RESTQ13127 1097 aa25.32■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 MOGSQ13724 837 aa25.32■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 GALNT17Q6IS24 598 aa25.32■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.32■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.32■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.32■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.32■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 BLIDQ8IZY5 108 aa25.32■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 ZMYND12Q9H0C1 365 aa25.32■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.32■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 PCDHA4Q9UN74 947 aa25.32■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 MYPNQ86TC9 1320 aa25.31■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 ICAM1P05362 532 aa25.31■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 OXER1Q8TDS5 423 aa25.31■■□□□ 1.64
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PSPC1-204ENST00000492741 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 KIF28PB7ZC32 967 aa25.3■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 ADCY7P51828 1080 aa25.3■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 NR5A1Q13285 461 aa25.3■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.3■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 BRAPQ7Z569 592 aa25.3■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 BICD2Q8TD16 824 aa25.3■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.3■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.29■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 ESYT2A0FGR8 921 aa25.29■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.29■■□□□ 1.641e-6■■■□□ 16
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PSPC1-204ENST00000492741 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.29■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.29■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 NOSTRINQ8IVI9 506 aa25.29■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.29■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 CUL5Q93034 780 aa25.29■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 PNMA3Q9UL41 463 aa25.29■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 PNMA2Q9UL42 364 aa25.29■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 GRM1Q13255 1194 aa25.28■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 PLS1Q14651 629 aa25.28■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 NPY5RQ15761 445 aa25.28■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 GBP4Q96PP9 640 aa25.28■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.28■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.28■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 BTBD19C9JJ37 291 aa25.27■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 SLC10A3P09131 477 aa25.27■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 NCLP19338 710 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.27■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.27■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF536O15090 1300 aa25.27■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 ABCB11O95342 1321 aa25.27■■□□□ 1.64
PSPC1-204ENST00000492741 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PSPC1-204ENST00000492741 PDHXO00330 501 aa25.26■■□□□ 1.63
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