RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 LRRC41Q15345 812 aa31.45■■■□□ 2.63
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ODC1-204ENST00000446285 TMEM47Q9BQJ4 181 aa31.45■■■□□ 2.63
ODC1-204ENST00000446285 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa31.45■■■□□ 2.63
ODC1-204ENST00000446285 PRR12Q9ULL5 1215 aa31.45■■■□□ 2.63
ODC1-204ENST00000446285 ZNF536O15090 1300 aa31.45■■■□□ 2.62
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ODC1-204ENST00000446285 RNF146Q9NTX7 359 aa31.44■■■□□ 2.62
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ODC1-204ENST00000446285 FERMT2Q96AC1 680 aa31.32■■■□□ 2.6
ODC1-204ENST00000446285 CST5P28325 142 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
ODC1-204ENST00000446285 CCDC144BQ3MJ40 725 aa31.31■■■□□ 2.6
ODC1-204ENST00000446285 TRIM60Q495X7 471 aa31.31■■■□□ 2.6
ODC1-204ENST00000446285 MUM1L1Q5H9M0 696 aa31.31■■■□□ 2.6
ODC1-204ENST00000446285 KLHDC9Q8NEP7 349 aa31.31■■■□□ 2.6
ODC1-204ENST00000446285 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
ODC1-204ENST00000446285 WDR19Q8NEZ3 1342 aa31.3■■■□□ 2.6
ODC1-204ENST00000446285 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa31.3■■■□□ 2.6
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