RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 PARD6BQ9BYG5 372 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 CYP21A2P08686 494 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 SLC12A2P55011 1212 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ARID5BQ14865 1188 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 BTBD18B2RXH4 712 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 FGAP02671 866 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 CASP14P31944 242 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 KIF11P52732 1056 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 PPP2R5EQ16537 467 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 PARP2Q9UGN5 583 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ATP8B1O43520 1251 aa9.75□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 MORC3Q14149 939 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 NECTIN1Q15223 517 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 NBPF14Q5TI25 921 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 SYCE1Q8N0S2 351 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ERBB3P21860 1342 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 CIAO1O76071 339 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 CTSWP56202 376 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 VEZTQ9HBM0 779 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 GPCPD1Q9NPB8 672 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 PKD2L1Q9P0L9 805 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 SASH1O94885 1247 aa9.75□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 PRR16Q569H4 304 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 NOSTRINQ8IVI9 506 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 JDP2Q8WYK2 163 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 HOOK2Q96ED9 719 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 SPTLC3Q9NUV7 552 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 KRIT1O00522 736 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 CALUO43852 315 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 SCRN1Q12765 414 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 HACE1Q8IYU2 909 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 NOD1Q9Y239 953 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 Q9H521 79 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 CHMP2AO43633 222 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 IFNAR2P48551 515 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 VPS41P49754 854 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA1Q5VX52 437 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 CABP7Q86V35 215 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 EFCAB13Q8IY85 973 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 PDE6AP16499 860 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 STRN3Q13033 797 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 TCP11Q8WWU5 503 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRM-202ENST00000400053 HOMER3Q9NSC5 361 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 MYO1AQ9UBC5 1043 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 USTQ9Y2C2 406 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 MYO1CO00159 1063 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 LPXNO60711 386 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 DNM2P50570 870 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 EIF6P56537 245 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ARHGAP4P98171 946 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 RAB17Q9H0T7 212 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 BAG5Q9UL15 447 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 CLEC11AQ9Y240 323 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 CEP152O94986 1710 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 KRT3P12035 628 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 CDC25BP30305 580 aa9.73□□□□□ -0.85
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