RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342018.12

GTF3C5-201, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GTF3C5, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-201ENST00000342018 SMCO2A6NFE2 343 aa22.23■■□□□ 1.15
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GTF3C5-201ENST00000342018 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.23■■□□□ 1.15
GTF3C5-201ENST00000342018 USP17L11C9JVI0 530 aa22.23■■□□□ 1.15
GTF3C5-201ENST00000342018 USP17L18D6R9N7 530 aa22.23■■□□□ 1.15
GTF3C5-201ENST00000342018 USP17L22D6RA61 530 aa22.23■■□□□ 1.15
GTF3C5-201ENST00000342018 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.23■■□□□ 1.15
GTF3C5-201ENST00000342018 USP17L19D6RCP7 530 aa22.23■■□□□ 1.15
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GTF3C5-201ENST00000342018 USP17L24Q0WX57 530 aa22.23■■□□□ 1.15
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GTF3C5-201ENST00000342018 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.22■■□□□ 1.15
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GTF3C5-201ENST00000342018 CPXCR1Q8N123 301 aa22.22■■□□□ 1.15
GTF3C5-201ENST00000342018 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
GTF3C5-201ENST00000342018 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
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GTF3C5-201ENST00000342018 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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GTF3C5-201ENST00000342018 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.21■■□□□ 1.15
GTF3C5-201ENST00000342018 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.21■■□□□ 1.15
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GTF3C5-201ENST00000342018 BRAPQ7Z569 592 aa22.2■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.2■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 ZBED4O75132 1171 aa22.19■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 GNA11P29992 359 aa22.19■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 DSG3P32926 999 aa22.19■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 ADCY7P51828 1080 aa22.19■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 SPRYD7Q5W111 196 aa22.19■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.19■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.19■■□□□ 1.14
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GTF3C5-201ENST00000342018 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.19■■□□□ 1.14
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GTF3C5-201ENST00000342018 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.19■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.18■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 FAM205CA6NFA0 338 aa22.18■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 GTF2A2P52657 109 aa22.18■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 MOGSQ13724 837 aa22.18■■□□□ 1.14
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GTF3C5-201ENST00000342018 GALNT17Q6IS24 598 aa22.18■■□□□ 1.14
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GTF3C5-201ENST00000342018 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.18■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.18■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
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GTF3C5-201ENST00000342018 KRT85P78386 507 aa22.16■■□□□ 1.14
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GTF3C5-201ENST00000342018 RGMBQ6NW40 437 aa22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 BICD2Q8TD16 824 aa22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
GTF3C5-201ENST00000342018 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.16■■□□□ 1.14
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