RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 TREML2Q5T2D2 321 aa25.48■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 SAPCD2Q86UD0 394 aa25.48■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 AMNQ9BXJ7 453 aa25.48■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 RESTQ13127 1097 aa25.48■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 COG2Q14746 738 aa25.48■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa25.48■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 CALML3P27482 149 aa25.47■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 FBXO11Q86XK2 927 aa25.47■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.47■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 BTBD18B2RXH4 712 aa25.46■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 DSG3P32926 999 aa25.46■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 SPRYD7Q5W111 196 aa25.46■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 CCDC174Q6PII3 467 aa25.46■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 BRMS1Q9HCU9 246 aa25.46■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 KRT2P35908 639 aa25.45■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 FSTL1Q12841 308 aa25.45■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 MOGSQ13724 837 aa25.45■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 ZMYND12Q9H0C1 365 aa25.45■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.45■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa25.45■■□□□ 1.67
CTU2-201ENST00000312060 SMCO2A6NFE2 343 aa25.45■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 KIF28PB7ZC32 967 aa25.45■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 FDX1P10109 184 aa25.45■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 GTF2A2P52657 109 aa25.45■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 TRAF1Q13077 416 aa25.45■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 NPY5RQ15761 445 aa25.45■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 GALNT17Q6IS24 598 aa25.45■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 PPP1R18Q6NYC8 613 aa25.45■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 ATG4CQ96DT6 458 aa25.45■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa25.45■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 ZBED4O75132 1171 aa25.44■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 CETPP11597 493 aa25.44■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.44■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 GNA11P29992 359 aa25.44■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 USH1GQ495M9 461 aa25.44■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 OXER1Q8TDS5 423 aa25.44■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 C6orf50Q9HD87 102 aa25.44■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 PCDHA4Q9UN74 947 aa25.44■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.44■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 ESYT2A0FGR8 921 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 TMEM88BA6NKF7 163 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 VWA5AO00534 786 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 RGMBQ6NW40 437 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 FAM173BQ6P4H8 233 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 BRAPQ7Z569 592 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 BLIDQ8IZY5 108 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 MYPNQ86TC9 1320 aa25.43■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 NR5A1Q13285 461 aa25.42■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP25.42■■□□□ 1.662e-12■■□□□ 13.7
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CTU2-201ENST00000312060 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.42■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 ICAM1P05362 532 aa25.42■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 GPAT2Q6NUI2 795 aa25.42■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.42■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 CPXCR1Q8N123 301 aa25.42■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 DAGLBQ8NCG7 672 aa25.42■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 ZNF536O15090 1300 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 CCL15Q16663 113 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 NOSTRINQ8IVI9 506 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 CHAMP1Q96JM3 812 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 GBP4Q96PP9 640 aa25.41■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 BAG4O95429 457 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 ADCY7P51828 1080 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 CLEC17AQ6ZS10 378 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 BICD2Q8TD16 824 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 AGBL1Q96MI9 1066 aa25.4■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 ADAMTS3O15072 1205 aa25.39■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 OSBPP22059 807 aa25.39■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 CUL5Q93034 780 aa25.39■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 PSTPIP2Q9H939 334 aa25.39■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 RIC8AQ9NPQ8 531 aa25.39■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 CCPG1Q9ULG6 757 aa25.39■■□□□ 1.66
CTU2-201ENST00000312060 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 REPS2Q8NFH8 660 aa25.39■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.39■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.39■■□□□ 1.65
CTU2-201ENST00000312060 PNMA2Q9UL42 364 aa25.39■■□□□ 1.65
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