RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000286428.5

VBP1-201, Transcript of VHL binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VBP1, Length 1,686 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1-201ENST00000286428 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.54■■□□□ 1.04
VBP1-201ENST00000286428 IQUBQ8NA54 791 aa21.54■■□□□ 1.04
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VBP1-201ENST00000286428 FZD9O00144 591 aa21.53■■□□□ 1.04
VBP1-201ENST00000286428 BMP3P12645 472 aa21.53■■□□□ 1.04
VBP1-201ENST00000286428 PTGER2P43116 358 aa21.53■■□□□ 1.04
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VBP1-201ENST00000286428 TTBK2Q6IQ55 1244 aa21.53■■□□□ 1.04
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VBP1-201ENST00000286428 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.53■■□□□ 1.04
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VBP1-201ENST00000286428 SERTAD1Q9UHV2 236 aa21.52■■□□□ 1.04
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VBP1-201ENST00000286428 SIPA1L1O43166 1804 aa21.52■■□□□ 1.03
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VBP1-201ENST00000286428 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
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VBP1-201ENST00000286428 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.5■■□□□ 1.03
VBP1-201ENST00000286428 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa21.5■■□□□ 1.03
VBP1-201ENST00000286428 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.5■■□□□ 1.03
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VBP1-201ENST00000286428 SEMA3FQ13275 785 aa21.47■■□□□ 1.03
VBP1-201ENST00000286428 AP3B2Q13367 1082 aa21.47■■□□□ 1.03
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