RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 ASNSP08243 561 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 EPS15P42566 896 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R18Q6NYC8 613 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 BTNL9Q6UXG8 535 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 BICD2Q8TD16 824 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 VAT1LQ9HCJ6 419 aa26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.14■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 KCTD1Q719H9 257 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP131Q9UPN4 1083 aa26.13■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 DCAF15Q66K64 600 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 SH2D4AQ9H788 454 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF112Q9UJU3 913 aa26.12■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB5O15062 677 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 BMP15O95972 392 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 BMP3P12645 472 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 GNA11P29992 359 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 NAPAP54920 295 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 HOMER1Q86YM7 354 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 ACER1Q8TDN7 264 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 GOPCQ9HD26 462 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 C6orf50Q9HD87 102 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 ATAD5Q96QE3 1844 aa26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM205CA6NFA0 338 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM75PA6NK02 468 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 ADAMTS3O15072 1205 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 CMA1P23946 247 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 LRSAM1Q6UWE0 723 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 ENGASEQ8NFI3 743 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHA6Q9UN73 950 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa26.1■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 USP17L10C9JJH3 530 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 PLA2G6O60733 806 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 CUTAO60888 179 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC16A2P36021 539 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 ECE1P42892 770 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 GAS2L3Q86XJ1 694 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 VCPKMTQ9H867 229 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 DACT1Q9NYF0 836 aa26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 SMCO2A6NFE2 343 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM160A1Q05DH4 1040 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 FSIP1Q8NA03 581 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 CLSTN2Q9H4D0 955 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 GGA3Q9NZ52 723 aa26.08■■□□□ 1.77
CAPNS1-207ENST00000589146 SYCE3A1L190 88 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 NR1I2O75469 434 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 PTPREP23469 700 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 TPRNQ4KMQ1 711 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 TTC38Q5R3I4 469 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 SYDE2Q5VT97 1194 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 KRT25Q7Z3Z0 450 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.07■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 QRICH1Q2TAL8 776 aa26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM232C9JQI7 657 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 RAD21O60216 631 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 GRIN3BO60391 1043 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 RESP18Q5W5W9 173 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 COA7Q96BR5 231 aa26.04■■□□□ 1.76
CAPNS1-207ENST00000589146 GLT8D2Q9H1C3 349 aa26.04■■□□□ 1.76
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