RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 RPS6KB1P23443 525 aa20.94■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 TM6SF1Q9BZW5 370 aa20.94■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 PORCNQ9H237 461 aa20.94■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.94■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa20.94■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.94■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.94■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 ANAPC15P60006 121 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 CATIPQ7Z7H3 387 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 EFCC1Q9HA90 598 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 FCGRTP55899 365 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 RUFY3Q7L099 469 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 STAG2Q8N3U4 1231 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 TRIM17Q9Y577 477 aa20.93■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC69A6NI79 296 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 ZBED4O75132 1171 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 CCNA1P78396 465 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 PLS1Q14651 629 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 ARHGEF6Q15052 776 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 IL17RAQ96F46 866 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 MYL10Q9BUA6 226 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 CPVLQ9H3G5 476 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.92■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 FDX1P10109 184 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 SNAP25P60880 206 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 GRM4Q14833 912 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 Q6ZUG5 572 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.91■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 ATP2A1O14983 1001 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 DDAH1O94760 285 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 MAPK4P31152 587 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 STAT3P40763 770 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 CPXCR1Q8N123 301 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 FBXL16Q8N461 479 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.9■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 KLRF2D3W0D1 207 aa20.89■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 GNRH1P01148 92 aa20.89■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 MAP3K14Q99558 947 aa20.89■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.89■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.89■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.94
SPNS1-208ENST00000566059 CENPFP49454 3210 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF536O15090 1300 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 ERCC3P19447 782 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 RXRAP19793 462 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 OAZ1P54368 228 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 FGD1P98174 961 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 APOA5Q6Q788 366 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 BRF1Q92994 677 aa20.89■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC174Q6PII3 467 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 GPR142Q7Z601 462 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 COA7Q96BR5 231 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 SRRDQ9UH36 339 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 GABRQQ9UN88 632 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 RIPK3Q9Y572 518 aa20.88■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 SLC25A27O95847 323 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 CALM1P0DP23 149 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 CALM2P0DP24 149 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 CALM3P0DP25 149 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 HOXD10P28358 340 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 PRKCZQ05513 592 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 WDR78Q5VTH9 848 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 AGBL1Q96MI9 1066 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 GJD2Q9UKL4 321 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.87■□□□□ 0.93
SPNS1-208ENST00000566059 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms