RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 BACH2Q9BYV9 841 aa5.82□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 ANTXR1Q9H6X2 564 aa5.82□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 KCNK12Q9HB15 430 aa5.82□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa5.82□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 NOTOA8MTQ0 251 aa5.81□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 BMP8BP34820 402 aa5.81□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 DLG4P78352 724 aa5.81□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 FANCCQ00597 558 aa5.81□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.81□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 HHIPL1Q96JK4 782 aa5.81□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 SLC9A7Q96T83 725 aa5.81□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 TM9SF2Q99805 663 aa5.81□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 FBXL21Q9UKT6 434 aa5.81□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa5.8□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 FKTNO75072 461 aa5.8□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 AUHQ13825 339 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 ADGRF1Q5T601 910 aa5.8□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 OLFML2BQ68BL8 750 aa5.8□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 TMEM132EQ6IEE7 984 aa5.8□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 FERD3LQ96RJ6 166 aa5.8□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 GFOD1Q9NXC2 390 aa5.8□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa5.8□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 FADS2P1A8MWK0 482 aa5.79□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 NUAK1O60285 661 aa5.79□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 ZNF205O95201 554 aa5.79□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 GSNP06396 782 aa5.79□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 PNLIPP16233 465 aa5.79□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 RTP1P59025 263 aa5.79□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 GALNT18Q6P9A2 607 aa5.79□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 C7orf61Q8IZ16 206 aa5.79□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 RNF34Q969K3 372 aa5.79□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 TAF6LQ9Y6J9 622 aa5.79□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 A0A1W2PQY0 241 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 ABLIM1O14639 778 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 VAMP1P23763 118 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 ARL4AP40617 200 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 PMS1P54277 932 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 SPATA32Q96LK8 384 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 DSCC1Q9BVC3 393 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 ERVK13-1Q9NX77 482 aa5.78□□□□□ -1.48
RRN3-204ENST00000561685 RFXAPO00287 272 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 EFEMP2O95967 443 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 ACRP10323 421 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 VAV1P15498 845 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 CTSKP43235 329 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 GALK1P51570 392 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 ERVFRD-1P60508 538 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 TMEM62Q0P6H9 643 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 LAPTM5Q13571 262 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 ZNF394Q53GI3 561 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 ZPBP2Q6X784 338 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 SIRT2Q8IXJ6 389 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 CDADC1Q9BWV3 514 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 GCM1Q9NP62 436 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 MINPP1Q9UNW1 487 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa5.77□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 C9IYK1 514 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 MEIS1O00470 390 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 SHOXO15266 292 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 GUCY2CP25092 1073 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 YBX1P67809 324 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 ZNF385BQ569K4 471 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 LCE4AQ5TA78 99 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 CRTC3Q6UUV7 619 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 SLCO6A1Q86UG4 719 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 SIRT5Q9NXA8 310 aa5.76□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 MPOP05164 745 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 FBXW10Q5XX13 1052 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 TMEM151BQ8IW70 566 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 ZNF654Q8IZM8 581 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 PLCD4Q9BRC7 762 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 ACSL6Q9UKU0 697 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 SLC12A7Q9Y666 1083 aa5.75□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 FAM86C2PA6NEL3 165 aa5.74□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 RECKO95980 971 aa5.74□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 CYP2R1Q6VVX0 501 aa5.74□□□□□ -1.49
RRN3-204ENST00000561685 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms