RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548477.5

SLC8B1-204, Transcript of solute carrier family 8 member B1, humanhuman

TSL 2

Gene SLC8B1, Length 2,053 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8B1-204ENST00000548477 SMARCA1P28370 1054 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 DPYDQ12882 1025 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.5■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 LAD1O00515 517 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 CCP110O43303 1012 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 NAPAP54920 295 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 DPF2Q92785 391 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 CEP95Q96GE4 821 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 M0R2N6 131 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 ZNF18P17022 549 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 RBM10P98175 930 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 PICALMQ13492 652 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 DTHD1Q6ZMT9 781 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.49■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 GNA11P29992 359 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 E2F4Q16254 413 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 SOGA3Q5TF21 947 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 TYW1BQ6NUM6 668 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 C6orf50Q9HD87 102 aa20.48■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 ZMYND12Q9H0C1 365 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 RMND1Q9NWS8 449 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 USP27XA6NNY8 438 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 F8W031 263 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 STAT6P42226 847 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 SLC35G1Q2M3R5 365 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 SPATA1Q5VX52 437 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 NYAP1Q6ZVC0 841 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 SWAP70Q9UH65 585 aa20.47■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 ADAMTS3O15072 1205 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 INF2Q27J81 1249 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 C2CD5Q86YS7 1000 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 CCDC125Q86Z20 511 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 C4orf32Q8N8J7 132 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 ZNF592Q92610 1267 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 SLX4Q8IY92 1834 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 H0YIN7 160 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 NOVP48745 357 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 IL17AQ16552 155 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 STYK1Q6J9G0 422 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 KLHL10Q6JEL2 608 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 USP17L2Q6R6M4 530 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 HOMER1Q86YM7 354 aa20.46■□□□□ 0.87
SLC8B1-204ENST00000548477 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 PRPHP41219 470 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 ASPRV1Q53RT3 343 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.45■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 TMEM232C9JQI7 657 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 CUL4BQ13620 913 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 CTAGE1Q96RT6 745 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 SMCO2A6NFE2 343 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 TUBB4AP04350 444 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 HLA-DOAP06340 250 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 CASP1P29466 404 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 TEKT1Q969V4 418 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 DISC1Q9NRI5 854 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 USP40Q9NVE5 1235 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.44■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 UBA7P41226 1012 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 GABPAQ06546 454 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 CERS5Q8N5B7 392 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 KIF18AQ8NI77 898 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 INTS13Q9NVM9 706 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 PRDM4Q9UKN5 801 aa20.43■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 ESYT2A0FGR8 921 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 PDHBP11177 359 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 DOK7Q18PE1 504 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 FILIP1LQ4L180 1135 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.42■□□□□ 0.86
SLC8B1-204ENST00000548477 USP17L5A8MUK1 530 aa20.42■□□□□ 0.86
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