RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		5.81	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089		C9IYK1	514 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	EPHX1	P07099	455 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	CYP7A1	P22680	504 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	CDK5R2	Q13319	367 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	DCAF15	Q66K64	600 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	CDC6	Q99741	560 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		5.8	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	KIF21B	O75037	1637 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	PPM1B	O75688	479 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	FST	P19883	344 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	IRAK1	P51617	712 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	RIN3	Q8TB24	985 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	MYRFL	Q96LU7	910 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		5.79	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	ABCA8	O94911	1581 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	SLITRK5	O94991	958 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	ASMTL	O95671	621 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	FAM153B	P0C7A2	387 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	ITGA4	P13612	1032 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	SQSTM1	Q13501	440 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	AUH	Q13825	339 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	TCEA2	Q15560	299 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	CD109	Q6YHK3	1445 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089		Q6ZS46	218 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	BEND4	Q6ZU67	534 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	ADCY4	Q8NFM4	1077 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	SGSM3	Q96HU1	749 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	ASPN	Q9BXN1	380 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM260	Q9NX78	707 aa		5.78	□□□□□ -1.48
MDM2-223	ENST00000536089	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	COBL	O75128	1261 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	CBX7	O95931	251 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	CD247	P20963	164 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	GRIK1	P39086	918 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	CD97	P48960	835 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	PLEKHG4	Q58EX7	1191 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	FBXO41	Q8TF61	875 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	RNF141	Q8WVD5	230 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	WHRN	Q9P202	907 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	AKT3	Q9Y243	479 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		5.77	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	FAM87A	P0C7U9	286 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	PPP2R5D	Q14738	602 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	ZC3H12B	Q5HYM0	836 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	BVES	Q8NE79	360 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	BRF1	Q92994	677 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	TBC1D32	Q96NH3	1257 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	FEZ1	Q99689	392 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	RAX	Q9Y2V3	346 aa		5.76	□□□□□ -1.49
MDM2-223	ENST00000536089	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		5.76	□□□□□ -1.49

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