RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 CEP95Q96GE4 821 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 MX1P20591 662 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP2A1O14983 1001 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 TFAP4Q01664 338 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 SLFN13Q68D06 897 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXO40Q9UH90 709 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.9■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 PARP14Q460N5 1801 aa22.89■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 FDX1P10109 184 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 BMP3P12645 472 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 PPARAQ07869 468 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM60Q495X7 471 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 C1orf53Q5VUE5 145 aa22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 PGK1P00558 417 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 OAZ1P54368 228 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 Q7L0L9 218 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 CHST13Q8NET6 341 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 PHF24Q9UPV7 400 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 RIPK3Q9Y572 518 aa22.88■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 SNX17Q15036 470 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.87■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 TSPY2A6NKD2 308 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM232C9JQI7 657 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC1A4P43007 532 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 STAT2P52630 851 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM160B2Q86V87 743 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 SPC25Q9HBM1 224 aa22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 TLE2Q04725 743 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 BADQ92934 168 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 EVI5LQ96CN4 794 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 STX8Q9UNK0 236 aa22.85■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.84■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 MYH4Q9Y623 1939 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1W2PQY0 241 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 ACVR2BQ13705 512 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 GMCL1Q96IK5 515 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.83■■□□□ 1.25
SH3BP2-220ENST00000511663 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CLTBP09497 229 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 MCCP23508 829 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ACAD9Q9H845 621 aa22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 DCDC2CA8MYV0 355 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 POTEB2H3BUK9 544 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 RAG1P15918 1043 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 ACLYP53396 1101 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 SHHQ15465 462 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 TKFCQ3LXA3 575 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.81■■□□□ 1.24
SH3BP2-220ENST00000511663 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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