RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DAAM2Q86T65 1068 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYNE4Q8N205 404 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC63Q8NA47 563 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF804BA4D1E1 1349 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1W2PQ27 194 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1W2PQ64 194 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A1W2PQD8 194 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NDUFAB1O14561 156 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP4A11Q02928 519 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPBP1Q86WP2 473 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RCOR1Q9UKL0 485 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CALUO43852 315 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR52Z1P0C646 297 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NEK8Q86SG6 692 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIGBQ92521 554 aa18.4■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SFMBT2Q5VUG0 894 aa18.39■□□□□ 0.54
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABCB4P21439 1286 aa18.39■□□□□ 0.53
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AFAP1L1Q8TED9 768 aa18.39■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAR1BQ9Y6B6 198 aa18.39■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MXRA7P84157 204 aa18.39■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NBPF14Q5TI25 921 aa18.39■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CERS3Q8IU89 383 aa18.39■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA6DP0CG33 693 aa18.39■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLD1P28340 1107 aa18.39■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DLGAP5Q15398 846 aa18.39■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA1Q5VX52 437 aa18.39■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP18.39■□□□□ 0.534e-7■■■■□ 22.3
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa18.39■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPIP5K2O43314 1243 aa18.38■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP2J2P51589 502 aa18.38■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKS4BQ8N8V4 417 aa18.38■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PICK1Q9NRD5 415 aa18.38■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GOLGA6BA6NDN3 693 aa18.38■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VIMP08670 466 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYOCDQ8IZQ8 938 aa18.38■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RICTORQ6R327 1708 aa18.38■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPS6KA1Q15418 735 aa18.38■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PEX26Q7Z412 305 aa18.38■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POLR3EQ9NVU0 708 aa18.38■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYO1AQ9UBC5 1043 aa18.38■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USP32Q8NFA0 1604 aa18.37■□□□□ 0.53
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GAS7O60861 476 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FLOT1O75955 427 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 B4DLN1 442 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 APBA3O96018 575 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPN1P04843 607 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 USTQ9Y2C2 406 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRB1P82279 1406 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CASP14P31944 242 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX12PQ92771 950 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BUB1O43683 1085 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STX10O60499 249 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RASGRF1Q13972 1273 aa18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFT74Q96LB3 600 aa18.37■□□□□ 0.53
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NRKQ7Z2Y5 1582 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PGBD1Q96JS3 809 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNM2P50570 870 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DIXDC1Q155Q3 683 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFT20Q8IY31 132 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPICE1Q8N0Z3 855 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NT5C3AQ9H0P0 336 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERFEQ4G0M1 354 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TTLL11Q8NHH1 800 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STK32BQ9NY57 414 aa18.36■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIML1Q8N9V2 468 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KIFAP3Q92845 792 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSNARE1Q96NA8 513 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ASIC3Q9UHC3 531 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RESTQ13127 1097 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TUBB2AQ13885 445 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HLFQ16534 295 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFAP221Q4G0U5 840 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF365Q70YC5 407 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TUBB2BQ9BVA1 445 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H7C1D1 291 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STAMBPO95630 424 aa18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SORBS3O60504 671 aa18.35■□□□□ 0.53
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