RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 CLIC4Q9Y696 253 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 STXBP3O00186 592 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 SPP2Q13103 211 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 CDCA5Q96FF9 252 aa24.09■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 SCYL3Q8IZE3 742 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 GMCL1Q96IK5 515 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 VCPKMTQ9H867 229 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 DOCK1Q14185 1865 aa24.08■■□□□ 1.45
SH3BP2-204ENST00000452765 TRAF5O00463 557 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 PTPRAP18433 802 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 ATP2B1P20020 1258 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 MTMR2Q13614 643 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 GPT2Q8TD30 523 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 BARHL2Q9NY43 387 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 ZHX2Q9Y6X8 837 aa24.08■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM75PA6NK02 468 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 XBP1P17861 261 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 NOSTRINQ8IVI9 506 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 GOPCQ9HD26 462 aa24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR90Q96KV7 1748 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 SPATA32Q96LK8 384 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 NMRK2Q9NPI5 230 aa24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 WNT7AO00755 349 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 SMARCA1P28370 1054 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 KRT2P35908 639 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 NAPAP54920 295 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 PICK1Q9NRD5 415 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 VGLL4Q14135 290 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 BRAPQ7Z569 592 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 HOOK2Q96ED9 719 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 CLMNQ96JQ2 1002 aa24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP24.05■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 KIFC2Q96AC6 838 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF408Q9H9D4 720 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 EMILIN3Q9NT22 766 aa24.04■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 ZBTB5O15062 677 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 TNFRSF25Q93038 417 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 MTMR8Q96EF0 704 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 OTOFQ9HC10 1997 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 SMCO2A6NFE2 343 aa24.03■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 STAT2P52630 851 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM87AQ8NBN3 555 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 PGBD1Q96JS3 809 aa24.02■■□□□ 1.44
SH3BP2-204ENST00000452765 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 HMGCS2P54868 508 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 MAP3K9P80192 1104 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 USH1GQ495M9 461 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 BLIDQ8IZY5 108 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 SH2D4AQ9H788 454 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 SH3GLB2Q9NR46 395 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 CFAP45Q9UL16 551 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHA4Q9UN74 947 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.01■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 RGS22Q8NE09 1264 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 ELP3Q9H9T3 547 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM260Q9NX78 707 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 BTNL9Q6UXG8 535 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHA6Q9UN73 950 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 VCAM1P19320 739 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 BACE1P56817 501 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 ANO1Q5XXA6 986 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC174Q6PII3 467 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 ZMYND12Q9H0C1 365 aa23.99■■□□□ 1.43
SH3BP2-204ENST00000452765 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms