RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439695.1

RPSAP41-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 41, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP41, Length 860 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP41-201ENST00000439695 KCNH1O95259 989 aa10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 PDGFRBP09619 1106 aa10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 NOS3P29474 1203 aa10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 HOXC12P31275 282 aa10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 GABREP78334 506 aa10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 MAP4K2Q12851 820 aa10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 LRRTM3Q86VH5 581 aa10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 KCTD13Q8WZ19 329 aa10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 BRF1Q92994 677 aa10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 PRDM14Q9GZV8 571 aa10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 LGR6Q9HBX8 967 aa10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 HOMER2Q9NSB8 354 aa10.23□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 EOMESO95936 686 aa10.22□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 APBA3O96018 575 aa10.22□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 SDSP20132 328 aa10.22□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 GFRA1P56159 465 aa10.22□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 FIBCD1Q8N539 461 aa10.22□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 MYRFLQ96LU7 910 aa10.22□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa10.22□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 TRIM39Q9HCM9 518 aa10.22□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 RXRBP28702 533 aa10.21□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 IREB2P48200 963 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 JAMLQ86YT9 394 aa10.21□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 TOP6BLQ8N6T0 577 aa10.21□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 GSTCDQ8NEC7 633 aa10.21□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 GIMAP7Q8NHV1 300 aa10.21□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.21□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa10.21□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 C1GALT1Q9NS00 363 aa10.21□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 GFOD1Q9NXC2 390 aa10.21□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 MCM8Q9UJA3 840 aa10.21□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
RPSAP41-201ENST00000439695 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 S100BP04271 92 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 SCG5P05408 212 aa10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 BMP3P12645 472 aa10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 NFKB2Q00653 900 aa10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 CDK5R2Q13319 367 aa10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 PPP2R5DQ14738 602 aa10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 FERMT3Q86UX7 667 aa10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 PPM1KQ8N3J5 372 aa10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 SLC7A14Q8TBB6 771 aa10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 DUSP23Q9BVJ7 150 aa10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 CYP26B1Q9NR63 512 aa10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 NDOR1Q9UHB4 597 aa10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 KCNH3Q9ULD8 1083 aa10.2□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 SIGLEC6O43699 453 aa10.19□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 LRRN2O75325 713 aa10.19□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 CPP00450 1065 aa10.19□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 ADGRE1Q14246 886 aa10.19□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 CNNM4Q6P4Q7 775 aa10.19□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 BRAPQ7Z569 592 aa10.19□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 FAM20CQ8IXL6 584 aa10.19□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 AHI1Q8N157 1196 aa10.19□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 ARMC10Q8N2F6 343 aa10.19□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 PTPRN2Q92932 1015 aa10.19□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 DSCC1Q9BVC3 393 aa10.19□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 SLC52A2Q9HAB3 445 aa10.19□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa10.18□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 PMLP29590 882 aa10.18□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 KIR3DL1P43629 444 aa10.18□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 AMPD2Q01433 879 aa10.18□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 MBTPS1Q14703 1052 aa10.18□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 SFRP5Q5T4F7 317 aa10.18□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 PAOXQ6QHF9 649 aa10.18□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa10.18□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa10.17□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 ALG1L2C9J202 215 aa10.17□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 ITIH2P19823 946 aa10.17□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 KCNJ6P48051 423 aa10.17□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 SF1Q15637 639 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 UBR7Q8N806 425 aa10.17□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 DTWD2Q8NBA8 298 aa10.17□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 TMEM145Q8NBT3 493 aa10.17□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 C1orf159Q96HA4 380 aa10.17□□□□□ -0.78
RPSAP41-201ENST00000439695 ZDHHC15Q96MV8 337 aa10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms