RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402613.3

VSTM2A-202, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VSTM2A, Length 1,076 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2A-202ENST00000402613 COPB2P35606 906 aa28.08■■■□□ 2.09
VSTM2A-202ENST00000402613 TEX13BQ9BXU2 312 aa28.08■■■□□ 2.09
VSTM2A-202ENST00000402613 SLC5A4Q9NY91 659 aa28.08■■■□□ 2.09
VSTM2A-202ENST00000402613 TMEM232C9JQI7 657 aa28.07■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 ATP2A1O14983 1001 aa28.07■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 OLFML2BQ68BL8 750 aa28.07■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 CHMP4CQ96CF2 233 aa28.07■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 MMP19Q99542 508 aa28.07■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa28.07■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 MYH4Q9Y623 1939 aa28.07■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 CYP2C19P33261 490 aa28.06■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 STAT2P52630 851 aa28.06■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 CPXCR1Q8N123 301 aa28.06■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 OGDHLQ9ULD0 1010 aa28.06■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 RIPK3Q9Y572 518 aa28.06■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 CHMLP26374 656 aa28.05■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 RCSD1Q6JBY9 416 aa28.05■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 FAM160B2Q86V87 743 aa28.05■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 ANKLE1Q8NAG6 615 aa28.05■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 CHURC1Q8WUH1 139 aa28.05■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 CTNNA3Q9UI47 895 aa28.05■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 ZNF236Q9UL36 1845 aa28.04■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 NEDD4P46934 1319 aa28.04■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 PLA2G6O60733 806 aa28.04■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 TOP1P11387 765 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 KCTD2Q14681 263 aa28.04■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 KCTD1Q719H9 257 aa28.04■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 ESR2Q92731 530 aa28.04■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 TMEM47Q9BQJ4 181 aa28.04■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 RAD50Q92878 1312 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 FDX1P10109 184 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 OAZ1P54368 228 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 LHX8Q68G74 356 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 RASGRP2Q7LDG7 609 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 MAML3Q96JK9 1138 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 TTC14Q96N46 770 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 HTATIP2Q9BUP3 242 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 MTMR7Q9Y216 660 aa28.03■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 PGK2P07205 417 aa28.02■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 SLC4A3P48751 1232 aa28.02■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 IKQ13123 557 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 TRPV1Q8NER1 839 aa28.02■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 DCAF4Q8WV16 495 aa28.02■■■□□ 2.08
VSTM2A-202ENST00000402613 NT5C2P49902 561 aa28.01■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 ZNF792Q3KQV3 632 aa28.01■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 DPF3Q92784 378 aa28.01■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 CYBAP13498 195 aa28■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 NECAB2Q7Z6G3 386 aa28■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 KDM4AO75164 1064 aa27.99■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 CNGA1P29973 690 aa27.99■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 CCDC96Q2M329 555 aa27.99■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa27.99■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 PRR12Q9ULL5 1215 aa27.99■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP27.98■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 CHST13Q8NET6 341 aa27.98■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 ZNF536O15090 1300 aa27.97■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 B4E1Z4 1266 aa27.97■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 MSCO60682 206 aa27.97■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa27.97■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 TTBK2Q6IQ55 1244 aa27.97■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 DGKHQ86XP1 1220 aa27.97■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 DDX11Q96FC9 970 aa27.97■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 FBXO40Q9UH90 709 aa27.97■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 SGSM2O43147 1006 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 PDHBP11177 359 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 SNAP25P60880 206 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 PTH1RQ03431 593 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 CCDC178Q5BJE1 867 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 BTNL9Q6UXG8 535 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 IQCA1Q86XH1 822 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 AGBL1Q96MI9 1066 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 KRT23Q9C075 422 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 ZSWIM5Q9P217 1185 aa27.96■■■□□ 2.07
VSTM2A-202ENST00000402613 TINF2Q9BSI4 451 aa27.95■■■□□ 2.06
VSTM2A-202ENST00000402613 CNNM2Q9H8M5 875 aa27.95■■■□□ 2.06
VSTM2A-202ENST00000402613 HOMER2Q9NSB8 354 aa27.95■■■□□ 2.06
VSTM2A-202ENST00000402613 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
VSTM2A-202ENST00000402613 H0YGN5 161 aa27.94■■■□□ 2.06
VSTM2A-202ENST00000402613 SLC16A2P36021 539 aa27.94■■■□□ 2.06
VSTM2A-202ENST00000402613 CCDC174Q6PII3 467 aa27.94■■■□□ 2.06
VSTM2A-202ENST00000402613 ANKRD35Q8N283 1001 aa27.94■■■□□ 2.06
VSTM2A-202ENST00000402613 ANKS1AQ92625 1134 aa27.94■■■□□ 2.06
VSTM2A-202ENST00000402613 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
VSTM2A-202ENST00000402613 C11orf49Q9H6J7 331 aa27.94■■■□□ 2.06
VSTM2A-202ENST00000402613 GPCPD1Q9NPB8 672 aa27.94■■■□□ 2.06
VSTM2A-202ENST00000402613 SEPT4O43236 478 aa27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms