RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 MUM1L1Q5H9M0 696 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 TTLL7Q6ZT98 887 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 CLIC6Q96NY7 704 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 UIMC1Q96RL1 719 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 GPR108Q9NPR9 543 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 TBC1D7Q9P0N9 293 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 BACH1O14867 736 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 CLCN6P51797 869 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 SEPT14Q6ZU15 432 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 KSR1Q8IVT5 923 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC51Q96ER9 411 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 VPS54Q9P1Q0 977 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 CDC23Q9UJX2 597 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 TXNDC9O14530 226 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 NELFCDQ8IXH7 590 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 FAM212AQ96EL1 285 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 MROH5Q6ZUA9 1318 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF532Q9HCE3 1301 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ENC1O14682 589 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 CTDSPL2Q05D32 466 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 HHATQ5VTY9 493 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 CCDC105Q8IYK2 499 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 PI4K2BQ8TCG2 481 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 ATP2A3Q93084 1043 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRM-202ENST00000400053 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 CMA1P23946 247 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 BIRC3Q13489 604 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 DPCR1Q3MIW9 517 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 SLC35F6Q8N357 371 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 EYA3Q99504 573 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 TSKSQ9UJT2 592 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 KRT15P19012 456 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 MTMR3Q13615 1198 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 PSMD6Q15008 389 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 TRIM58Q8NG06 486 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 IQCDQ96DY2 449 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 KCNJ18B7U540 433 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 DAPK3O43293 454 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 IFT88Q13099 833 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 KCNJ12Q14500 433 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 E2F5Q15329 346 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 RNF34Q969K3 372 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 HAUS4Q9H6D7 363 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 JRKLQ9Y4A0 524 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 BUB1O43683 1085 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 HIP1RO75146 1068 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 KRT5P13647 590 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 TERF2Q15554 542 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 SFMBT2Q5VUG0 894 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 HAUS3Q68CZ6 603 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 DENND2CQ68D51 928 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA5Q8NB90 893 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 PLCB1Q9NQ66 1216 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ABCA9Q8IUA7 1624 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 TULP4Q9NRJ4 1543 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 GOLGA8KD6RF30 607 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 KCNK3O14649 394 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 GYS2P54840 703 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 CLIC4Q9Y696 253 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 LDHBP07195 334 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 RPAINQ86UA6 219 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 DPH5Q9H2P9 285 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 HYOU1Q9Y4L1 999 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ADCY9O60503 1353 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 COBLO75128 1261 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 RNF40O75150 1001 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 FLOT1O75955 427 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 STX2P32856 288 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 LRRC24Q50LG9 513 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PTPRM-202ENST00000400053 P3H4Q92791 437 aa9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms