RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340491.8

DLGAP4-202, Transcript of DLG associated protein 4, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene DLGAP4, Length 2,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLGAP4-202ENST00000340491 USP40Q9NVE5 1235 aa16.1■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 21.4
DLGAP4-202ENST00000340491 NAPAP54920 295 aa16.09■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 GABPAQ06546 454 aa16.09■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 CERS3Q8IU89 383 aa16.09■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 ZFPM1Q8IX07 1006 aa16.09■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 TOP1P11387 765 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 NFIAQ12857 509 aa16.09■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 NYAP1Q6ZVC0 841 aa16.09■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 ZNF710Q8N1W2 664 aa16.09■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 CCDC150Q8NCX0 1101 aa16.09■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 SPZ1Q9BXG8 430 aa16.09■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 SMCO2A6NFE2 343 aa16.08■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa16.08■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 CBFA2T2O43439 604 aa16.08■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 CACNB3P54284 484 aa16.08■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 CEP135Q66GS9 1140 aa16.08■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa16.08■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 IQUBQ8NA54 791 aa16.08■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 MTMR4Q9NYA4 1195 aa16.08■□□□□ 0.17
DLGAP4-202ENST00000340491 PDHBP11177 359 aa16.08■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 TMC4Q7Z404 712 aa16.08■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 DAGLBQ8NCG7 672 aa16.08■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 CCDC148Q8NFR7 591 aa16.08■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 LRRC15Q8TF66 581 aa16.08■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 ZMYND12Q9H0C1 365 aa16.08■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 DACH1Q9UI36 760 aa16.08■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 NOVP48745 357 aa16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 NT5C2P49902 561 aa16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 PTPN14Q15678 1187 aa16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 TMEM260Q9NX78 707 aa16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 PARP3Q9Y6F1 533 aa16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 FAM196BA6NMK8 535 aa16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 TEX33O43247 280 aa16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 LETM2Q2VYF4 491 aa16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 COA7Q96BR5 231 aa16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 GSDMAQ96QA5 445 aa16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 GPCPD1Q9NPB8 672 aa16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 FOCADQ5VW36 1801 aa16.07■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 G3V3G9 751 aa16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 PLSCR1O15162 318 aa16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 ALDH1B1P30837 517 aa16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 NAALADL2Q58DX5 795 aa16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 DTHD1Q6ZMT9 781 aa16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 ARID3AQ99856 593 aa16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 LZTS2Q9BRK4 669 aa16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 CTNND2Q9UQB3 1225 aa16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 SHMT1P34896 483 aa16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 LONP1P36776 959 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 ADKP55263 362 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 KIAA0825Q8IV33 1275 aa16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 MASTLQ96GX5 879 aa16.06■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 PDE6BP35913 854 aa16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 TCP10Q12799 353 aa16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 TTBK2Q6IQ55 1244 aa16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 SERPINB13Q9UIV8 391 aa16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 GDAQ9Y2T3 454 aa16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 NRXN2Q9P2S2 1712 aa16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 STAT6P42226 847 aa16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 NR1I3Q14994 352 aa16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 SPATA1Q5VX52 437 aa16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 RRAGBQ5VZM2 374 aa16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 TMEM139Q8IV31 216 aa16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 CCDC34Q96HJ3 373 aa16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 TMX1Q9H3N1 280 aa16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 DISC1Q9NRI5 854 aa16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 CHRNA5P30532 468 aa16.04■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 ATP2B2Q01814 1243 aa16.04■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 RIOX1Q9H6W3 641 aa16.04■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 MYO1BO43795 1136 aa16.04■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 RRP9O43818 475 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 SLC16A2P36021 539 aa16.04■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 CRKP46108 304 aa16.04■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 GALNT17Q6IS24 598 aa16.04■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 C2CD5Q86YS7 1000 aa16.04■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 TBCKQ8TEA7 893 aa16.04■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 TEKT1Q969V4 418 aa16.04■□□□□ 0.16
DLGAP4-202ENST00000340491 DNAJC18Q9H819 358 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.2 ms