RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293778.10

CXCL16-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 16, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL16, Length 2,222 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL16-201ENST00000293778 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
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CXCL16-201ENST00000293778 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa22.65■■□□□ 1.22
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CXCL16-201ENST00000293778 LETM2Q2VYF4 491 aa22.57■■□□□ 1.2
CXCL16-201ENST00000293778 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CXCL16-201ENST00000293778 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.57■■□□□ 1.2
CXCL16-201ENST00000293778 USP40Q9NVE5 1235 aa22.57■■□□□ 1.2
CXCL16-201ENST00000293778 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CXCL16-201ENST00000293778 ALDH1B1P30837 517 aa22.56■■□□□ 1.2
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