RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000211413.9

PRRT1-201, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,909 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-201ENST00000211413 SMCHD1A6NHR9 2005 aa21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 PKN1Q16512 942 aa21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 ASPRV1Q53RT3 343 aa21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 GMCL1Q96IK5 515 aa21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 PIGSQ96S52 555 aa21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 TREML2Q5T2D2 321 aa21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 SH2D4AQ9H788 454 aa21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 PPATQ06203 517 aa21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.53■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 SYT1P21579 422 aa21.52■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 GADL1Q6ZQY3 521 aa21.52■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 KIFC2Q96AC6 838 aa21.52■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.52■■□□□ 1.04
PRRT1-201ENST00000211413 PEX10O60683 326 aa21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF445P59923 1031 aa21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 WNK4Q96J92 1243 aa21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 ALG1Q9BT22 464 aa21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 ADAMTS3O15072 1205 aa21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 PPP2R5BQ15173 497 aa21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.51■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 CDKL5O76039 1030 aa21.5■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 GNAQP50148 359 aa21.5■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 FKBP1BP68106 108 aa21.5■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 PPIL2Q13356 520 aa21.5■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.5■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 PRR12Q9ULL5 1215 aa21.5■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.5■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 GRM1Q13255 1194 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 C19orf81C9J6K1 198 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 STAT2P52630 851 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 USP14P54578 494 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 MOGSQ13724 837 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 COA7Q96BR5 231 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 SPZ1Q9BXG8 430 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 TMOD4Q9NZQ9 345 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.49■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 WDR46O15213 610 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 FLOT1O75955 427 aa21.48■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 BRD1O95696 1058 aa21.48■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 HTRA3P83110 453 aa21.48■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 KCNH4Q9UQ05 1017 aa21.48■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 DEXIO95424 95 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 SH3D19Q5HYK7 790 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 CCDC174Q6PII3 467 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 FERMT3Q86UX7 667 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 LPAR1Q92633 364 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 SPRYD7Q5W111 196 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.47■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 RLFQ13129 1914 aa21.46■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 STX6O43752 255 aa21.46■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 SCG2P13521 617 aa21.46■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.46■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 C8orf76Q96K31 380 aa21.46■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 C12orf42Q96LP6 360 aa21.46■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 ZIC5Q96T25 663 aa21.46■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 LZTS2Q9BRK4 669 aa21.46■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 STK36Q9NRP7 1315 aa21.46■■□□□ 1.03
PRRT1-201ENST00000211413 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 CXCL11O14625 94 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 POTEEQ6S8J3 1075 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 RASAL3Q86YV0 1011 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 ATG4CQ96DT6 458 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 MTMR6Q9Y217 621 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.45■■□□□ 1.02
PRRT1-201ENST00000211413 PARP14Q460N5 1801 aa21.45■■□□□ 1.02
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