RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626874.2

CHD2-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CHD2, Length 7,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD2-208	ENST00000626874	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CHD2-208	ENST00000626874	EYA2	O00167	538 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CHD2-208	ENST00000626874	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	7.59	□□□□□ -1.19
CHD2-208	ENST00000626874	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CHD2-208	ENST00000626874	SDS	P20132	328 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CHD2-208	ENST00000626874	PRR16	Q569H4	304 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CHD2-208	ENST00000626874	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.19
CHD2-208	ENST00000626874	MLKL	Q8NB16	471 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CHD2-208	ENST00000626874	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CHD2-208	ENST00000626874	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		7.59	□□□□□ -1.19
CHD2-208	ENST00000626874	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		7.59	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		7.59	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		7.59	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	7.59	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		7.59	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	ATP10D	Q9P241	1426 aa		7.59	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	CA4	P22748	312 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	RXRB	P28702	533 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	PDE1A	P54750	535 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	PAK1	Q13153	545 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	DENND2C	Q68D51	928 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	ISM2	Q6H9L7	571 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	C8orf74	Q6P047	294 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	RUFY3	Q7L099	469 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	MMS19	Q96T76	1030 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	MED7	O43513	233 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	MYO1E	Q12965	1108 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	ASXL2	Q76L83	1435 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	SNX25	Q9H3E2	840 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	TBX22	Q9Y458	520 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	TTC4	O95801	387 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	ARMCX2	Q7L311	632 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	TLDC2	A0PJX2	215 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	TTI1	O43156	1089 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	NNMT	P40261	264 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	STAT1	P42224	750 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	DRC3	Q9H069	523 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	PRX	Q9BXM0	1461 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	TMCC1	O94876	653 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	SPDYE6	P0CI01	402 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	COPB2	P35606	906 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	PDE6C	P51160	858 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	PPP2R5C	Q13362	524 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	DNAI1	Q9UI46	699 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	ITM2B	Q9Y287	266 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		7.58	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	SEMA3E	O15041	775 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	F13A1	P00488	732 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	TTC38	Q5R3I4	469 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	KCNA6	P17658	529 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	WASHC5	Q12768	1159 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	MCM6	Q14566	821 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	COG7	P83436	770 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	PAK2	Q13177	524 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	GANC	Q8TET4	914 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	CHMP6	Q96FZ7	201 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	KIF2C	Q99661	725 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	RYBP	Q8N488	228 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	ST7	Q9NRC1	585 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	USP40	Q9NVE5	1235 aa		7.57	□□□□□ -1.2
CHD2-208	ENST00000626874	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		7.57	□□□□□ -1.2

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