RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612161.4

SLC38A1-211, Transcript of solute carrier family 38 member 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC38A1, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A1-211ENST00000612161 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 AHI1Q8N157 1196 aa7.34□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 MYRIPQ8NFW9 859 aa7.34□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.34□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 CEP63Q96MT8 703 aa7.34□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 LZTS1Q9Y250 596 aa7.34□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 GRIN2AQ12879 1464 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 A0A096LPE4 126 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 A0A1W2PPZ6 126 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 ACPPP15309 386 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 CASQ1P31415 396 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 ABCD1P33897 745 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 MAGEA8P43361 318 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 FAM209AQ5JX71 171 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 FAM83BQ5T0W9 1011 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 CFAP53Q96M91 514 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 SARGQ9BW04 601 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 PPCSQ9HAB8 311 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 ZNF69Q9UC07 566 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 SCINQ9Y6U3 715 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.33□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 ADAMTS12P58397 1594 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 CFAP69A5D8W1 941 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 METTL12A8MUP2 240 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 ACRBPQ8NEB7 543 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 OSGEPQ9NPF4 335 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 PRDM11Q9NQV5 511 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 SUN2Q9UH99 717 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 TRHDEQ9UKU6 1024 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 IL16Q14005 1332 aa7.32□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 KDM6BO15054 1643 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 SHROOM2Q13796 1616 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 VSTM5A8MXK1 200 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 SASH3O75995 380 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 NME2P22392 152 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 PHKA2P46019 1235 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.242e-6■□□□□ 9.2
SLC38A1-211ENST00000612161 NNTQ13423 1086 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 PKN3Q6P5Z2 889 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 PJA1Q8NG27 643 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 KLHL6Q8WZ60 621 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 TSPOAP1O95153 1857 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 TNKSO95271 1327 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 ERBB4Q15303 1308 aa7.31□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 BICDL2A1A5D9 508 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 NFKBIEO00221 500 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 PES1O00541 588 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 NPHP1O15259 732 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 GRIN3BO60391 1043 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 ACRP10323 421 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 VDRP11473 427 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 SOX18P35713 384 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 KCNQ4P56696 695 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 PICALMQ13492 652 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 LRRC14Q15048 493 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 SYDE2Q5VT97 1194 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 RUNDC1Q96C34 613 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 ITPKCQ96DU7 683 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 AGAP3Q96P47 875 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 CDC6Q99741 560 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 BRD7Q9NPI1 651 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 USP25Q9UHP3 1055 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 H0YHG0 523 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 TCEA3O75764 348 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 FLT3P36888 993 aa7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SLC38A1-211ENST00000612161 IL31Q6EBC2 164 aa7.3□□□□□ -1.24
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