RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ABCD4-223	ENST00000555904	HSCB	Q8IWL3	235 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ABCD4-223	ENST00000555904	CAPNS2	Q96L46	248 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ABCD4-223	ENST00000555904	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
ABCD4-223	ENST00000555904	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
ABCD4-223	ENST00000555904	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
ABCD4-223	ENST00000555904	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
ABCD4-223	ENST00000555904	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		14.59	□□□□□ -0.07
ABCD4-223	ENST00000555904	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
ABCD4-223	ENST00000555904	CPLX1	O14810	134 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	SNHG28	P0DPA3	235 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	RXRA	P19793	462 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	GNAQ	P50148	359 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	STAT2	P52630	851 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	STK3	Q13188	491 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	GRM4	Q14833	912 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	RTN1	Q16799	776 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	CPLX2	Q6PUV4	134 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	FANCB	Q8NB91	859 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	PNMA3	Q9UL41	463 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	USP17L15	C9J2P7	530 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	USP17L11	C9JVI0	530 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	USP17L18	D6R9N7	530 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	USP17L22	D6RA61	530 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	USP17L19	D6RCP7	530 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	USP17L20	D6RJB6	530 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF543	Q08ER8	600 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	USP17L24	Q0WX57	530 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	KCTD1	Q719H9	257 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	FEM1B	Q9UK73	627 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		14.57	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	MYH4	Q9Y623	1939 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	TMEM232	C9JQI7	657 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	KLRF2	D3W0D1	207 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	FLOT1	O75955	427 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	CDKL5	O76039	1030 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	OSBP	P22059	807 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	DGKZ	Q13574	1117 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	BECN1	Q14457	450 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM160B2	Q86V87	743 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	SNX21	Q969T3	373 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	NID2	Q14112	1375 aa		14.56	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	PFKFB2	O60825	505 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	ME3	Q16798	604 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	TREML2	Q5T2D2	321 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		14.55	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	PDHX	O00330	501 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	HTRA3	P83110	453 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	GTF3C6	Q969F1	213 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	KIFC2	Q96AC6	838 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	MYPN	Q86TC9	1320 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	BTBD19	C9JJ37	291 aa		14.53	□□□□□ -0.08
ABCD4-223	ENST00000555904	PLA2G6	O60733	806 aa		14.53	□□□□□ -0.08

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