RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 COPB2P35606 906 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 KCTD2Q14681 263 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 TDHQ8IZJ6 230 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 MMP19Q99542 508 aa23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 ERC2O15083 957 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 SEPT4O43236 478 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 STAT3P40763 770 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 TDO2P48775 406 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 TRPV1Q8NER1 839 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 LRCH3Q96II8 777 aa23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 MYH7P12883 1935 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 VWA5AO00534 786 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 OSBP2Q969R2 916 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 MAML3Q96JK9 1138 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.02■■□□□ 1.28
SH3BP2-220ENST00000511663 GPAA1O43292 621 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 NACAP1Q9BZK3 213 aa23.01■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 NYAP2Q9P242 653 aa23.01■■□□□ 1.27
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SH3BP2-220ENST00000511663 IGHA2P01877 340 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 RASA1P20936 1047 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 LRIT3Q3SXY7 679 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 ANO1Q5XXA6 986 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR153Q6NV75 609 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 F5H6K3 240 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 KLRC3Q07444 240 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 RLFQ13129 1914 aa22.98■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBED4O75132 1171 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 PGK2P07205 417 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 RARBP10826 455 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC4A3P48751 1232 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 RTP1P59025 263 aa22.97■■□□□ 1.27
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SH3BP2-220ENST00000511663 DDX11Q96FC9 970 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 TINF2Q9BSI4 451 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 FSD1Q9BTV5 496 aa22.97■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 TEX13BQ9BXU2 312 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.96■■□□□ 1.27
SH3BP2-220ENST00000511663 M0R2C6 588 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 PRDM1O75626 825 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 NDUFB10O96000 172 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF180Q86T96 592 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 DEFB123Q8N688 67 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 NAPBQ9H115 298 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.95■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 TTLL1O95922 423 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 TSPY3P0CV98 308 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 TSPY8P0CW00 308 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC41Q15345 812 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 CPXCR1Q8N123 301 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 MKL1Q969V6 931 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 FEM1BQ9UK73 627 aa22.94■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 REPS2Q8NFH8 660 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 FERMT2Q96AC1 680 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 KIFC2Q96AC6 838 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.93■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 AKR1A1P14550 325 aa22.92■■□□□ 1.26
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.92■■□□□ 1.26
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