RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504936.1

PITX1-204, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 2

Gene PITX1, Length 770 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-204ENST00000504936 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.43■■□□□ 1.18
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PITX1-204ENST00000504936 ATG4CQ96DT6 458 aa22.43■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.43■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.43■■□□□ 1.18
PITX1-204ENST00000504936 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
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PITX1-204ENST00000504936 TRDNQ13061 729 aa22.42■■□□□ 1.18
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PITX1-204ENST00000504936 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.33■■□□□ 1.17
PITX1-204ENST00000504936 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
PITX1-204ENST00000504936 SLC27A2O14975 620 aa22.32■■□□□ 1.16
PITX1-204ENST00000504936 RGS2P41220 211 aa22.32■■□□□ 1.16
PITX1-204ENST00000504936 UBXN2AP68543 259 aa22.32■■□□□ 1.16
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