RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	USP14	P54578	494 aa		33.2	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	SPP2	Q13103	211 aa		33.2	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		33.2	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	GMCL1	Q96IK5	515 aa		33.2	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	VCPKMT	Q9H867	229 aa		33.2	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		33.19	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	NDUFB10	O96000	172 aa		33.19	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	PPAT	Q06203	517 aa		33.19	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		33.19	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	33.19	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	SLC1A4	P43007	532 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC96	Q2M329	555 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		33.18	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	C19orf81	C9J6K1	198 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	BACE1	P56817	501 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	MTMR2	Q13614	643 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	33.17	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		33.17	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	TRIM75P	A6NK02	468 aa		33.16	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF543	Q08ER8	600 aa		33.16	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	LPAR1	Q92633	364 aa		33.16	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		33.16	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	PTPRF	P10586	1907 aa		33.16	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	MYH6	P13533	1939 aa		33.16	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	PPIL2	Q13356	520 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	OTUD5	Q96G74	571 aa		33.15	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	33.15	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	KLRF2	D3W0D1	207 aa		33.14	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	IFNAR1	P17181	557 aa		33.14	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		33.14	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		33.14	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		33.14	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	OPTN	Q96CV9	577 aa		33.14	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	ABHD8	Q96I13	439 aa		33.14	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
TTC19-208	ENST00000497842	CTDNEP1	O95476	244 aa		33.13	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		33.13	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	BMP3	P12645	472 aa		33.13	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	NTRK3	Q16288	839 aa		33.13	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		33.13	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		33.13	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		33.12	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		33.11	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	CXCL11	O14625	94 aa		33.11	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	HUNK	P57058	714 aa		33.11	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		33.11	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	KCTD1	Q719H9	257 aa		33.11	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		33.11	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		33.11	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	SMARCA1	P28370	1054 aa		33.1	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	C12orf42	Q96LP6	360 aa		33.1	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		33.1	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	JAK2	O60674	1132 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	HMGCS2	P54868	508 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	KIF3A	Q9Y496	699 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	IRF6	O14896	467 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	FUT2	Q10981	343 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	FAM83B	Q5T0W9	1011 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	PHKB	Q93100	1093 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		33.09	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	STK36	Q9NRP7	1315 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	GJB2	P29033	226 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	NBPF11	Q86T75	865 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	DDX11	Q96FC9	970 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	WNK4	Q96J92	1243 aa		33.08	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	ORC3	Q9UBD5	711 aa	Predicted RBP	33.08	■■■□□ 2.89
TTC19-208	ENST00000497842	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM232	C9JQI7	657 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	CAPNS2	Q96L46	248 aa		33.07	■■■□□ 2.88
TTC19-208	ENST00000497842	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	33.07	■■■□□ 2.88

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