RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493711.1

SNX17-208, Transcript of sorting nexin 17, humanhuman

TSL 3

Gene SNX17, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17-208ENST00000493711 VCPKMTQ9H867 229 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX17-208ENST00000493711 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SNX17-208ENST00000493711 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX17-208ENST00000493711 KCNH4Q9UQ05 1017 aa14.52□□□□□ -0.09
SNX17-208ENST00000493711 F5H6K3 240 aa14.51□□□□□ -0.09
SNX17-208ENST00000493711 ZBTB43O43298 467 aa14.51□□□□□ -0.09
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SNX17-208ENST00000493711 SNHG28P0DPA3 235 aa14.49□□□□□ -0.09
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SNX17-208ENST00000493711 ZNF543Q08ER8 600 aa14.47□□□□□ -0.09
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SNX17-208ENST00000493711 EMILIN3Q9NT22 766 aa14.47□□□□□ -0.09
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SNX17-208ENST00000493711 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa14.47□□□□□ -0.09
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SNX17-208ENST00000493711 USP17L11C9JVI0 530 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX17-208ENST00000493711 USP17L18D6R9N7 530 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX17-208ENST00000493711 USP17L22D6RA61 530 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX17-208ENST00000493711 USP17L17D6RBQ6 530 aa14.46□□□□□ -0.09
SNX17-208ENST00000493711 USP17L19D6RCP7 530 aa14.46□□□□□ -0.09
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