RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492947.1

AGRN-209, Transcript of agrin, humanhuman

TSL 2

Gene AGRN, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRN-209ENST00000492947 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
AGRN-209ENST00000492947 APBA2Q99767 749 aa20.08■□□□□ 0.81
AGRN-209ENST00000492947 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
AGRN-209ENST00000492947 GOPCQ9HD26 462 aa20.08■□□□□ 0.81
AGRN-209ENST00000492947 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
AGRN-209ENST00000492947 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.08■□□□□ 0.81
AGRN-209ENST00000492947 PARP14Q460N5 1801 aa20.08■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 SLC15A5A6NIM6 579 aa20.07■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 TFRCP02786 760 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 SDSP20132 328 aa20.07■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 PPARAQ07869 468 aa20.07■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 LHX8Q68G74 356 aa20.07■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.07■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.07■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.07■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 WDR46O15213 610 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 ALX1Q15699 326 aa20.06■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.06■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.06■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.06■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.05■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.05■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 MB21D1Q8N884 522 aa20.05■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.05■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 ATG4CQ96DT6 458 aa20.05■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 FAM227BQ96M60 508 aa20.05■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 TANGO6Q9C0B7 1094 aa20.05■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 PRO3102Q9H379 93 aa20.05■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 TSPY3P0CV98 308 aa20.04■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 TSPY8P0CW00 308 aa20.04■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.04■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 REPS2Q8NFH8 660 aa20.04■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.04■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 NYAP2Q9P242 653 aa20.04■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.03■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 A0A0D9SFI3 127 aa20.03■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 FLOT1O75955 427 aa20.03■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 ERCC3P19447 782 aa20.03■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 MKL1Q969V6 931 aa20.03■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.03■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 SZT2Q5T011 3432 aa20.02■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 STRNO43815 780 aa20.02■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 RAD21O60216 631 aa20.02■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 COBLO75128 1261 aa20.02■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 COL6A1P12109 1028 aa20.02■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 DPF3Q92784 378 aa20.02■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.02■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa20.02■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.02■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.02■□□□□ 0.8
AGRN-209ENST00000492947 ALPK3Q96L96 1907 aa20.02■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 PRDM1O75626 825 aa20.01■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 TTLL1O95922 423 aa20.01■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 FGAP02671 866 aa20.01■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 ADORA2AP29274 412 aa20.01■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 TRPV1Q8NER1 839 aa20.01■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.01■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 MTMR4Q9NYA4 1195 aa20.01■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.01■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.01■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 TSPY2A6NKD2 308 aa20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 F5H6K3 240 aa20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 VWA5AO00534 786 aa20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 PCP11498 1178 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 TFAP4Q01664 338 aa20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 KLRC3Q07444 240 aa20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 TTC22Q5TAA0 569 aa20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 VPS53Q5VIR6 699 aa20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 ABRAQ8N0Z2 381 aa20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 RUFY2Q8WXA3 655 aa20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 CEP95Q96GE4 821 aa20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 MROH8Q9H579 483 aa20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 PFASO15067 1338 aa20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 ZMYM6O95789 1325 aa20■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 NDUFB10O96000 172 aa19.99■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 WDR78Q5VTH9 848 aa19.99■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 OLFML2BQ68BL8 750 aa19.99■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 TOMM22Q9NS69 142 aa19.99■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 LAMA3Q16787 3333 aa19.99■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 CYBAP13498 195 aa19.98■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 PDE4AP27815 886 aa19.98■□□□□ 0.79
AGRN-209ENST00000492947 CYP2C19P33261 490 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.2 ms