RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486708.1

SFI1-224, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 2

Gene SFI1, Length 651 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-224	ENST00000486708	GNAI1	P63096	354 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	DDR1	Q08345	913 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	DGKZ	Q13574	1117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	LAMC2	Q13753	1193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	PARP10	Q53GL7	1025 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	SOGA3	Q5TF21	947 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	USP48	Q86UV5	1035 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	CNBD1	Q8NA66	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	SPC24	Q8NBT2	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	NYX	Q9GZU5	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	BTAF1	O14981	1849 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	ABCC4	O15439	1325 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	C4B	P0C0L5	1744 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	RGPD5	Q99666	1765 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	ATP10D	Q9P241	1426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	ELOA3C	A0A087WX78	387 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	ELOA3D	A6NLF2	546 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	ERC2	O15083	957 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	REC8	O95072	547 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	DPEP1	P16444	411 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	PTGS1	P23219	599 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	MCM2	P49736	904 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	TERF2	Q15554	542 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	RTN1	Q16799	776 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	SMIM5	Q71RC9	77 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	ELOA3	Q8NG57	546 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708	LY75	O60449	1722 aa		4.9	□□□□□ -1.62
SFI1-224	ENST00000486708		A0A0G2JLW4	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	AP5Z1	O43299	807 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	ZNF853	P0CG23	659 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	CAPN2	P17655	700 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	MX1	P20591	662 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	ALAS2	P22557	587 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	MCC	P23508	829 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	NEK4	P51957	841 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	ARHGAP4	P98171	946 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	CUL4A	Q13619	759 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	TTLL6	Q8N841	843 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	TRIM11	Q96F44	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	MASTL	Q96GX5	879 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	PLVAP	Q9BX97	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	HYPK	Q9NX55	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	SBF2	Q86WG5	1849 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SFI1-224	ENST00000486708	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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