RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHA2P01877 340 aa31.31■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APPP05067 770 aa31.31■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM132BQ14DG7 1078 aa31.31■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABRAQ8N0Z2 381 aa31.31■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PI4K2BQ8TCG2 481 aa31.31■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP31.31■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO28Q9NVF7 368 aa31.31■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRMPD3Q5JV73 1810 aa31.31■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa31.3■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COBLO75128 1261 aa31.29■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A27O95847 323 aa31.29■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM83BQ5T0W9 1011 aa31.29■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRPV1Q8NER1 839 aa31.29■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP31.28■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FCER1AP12319 257 aa31.28■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYBAP13498 195 aa31.28■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FSD1Q9BTV5 496 aa31.28■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF287Q9HBT7 754 aa31.28■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NYAP2Q9P242 653 aa31.28■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa31.28■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYN1P17600 705 aa31.27■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFNL3Q8IZI9 196 aa31.27■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GDF15Q99988 308 aa31.27■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.6
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VWA5AO00534 786 aa31.26■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MX1P20591 662 aa31.26■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIOX2Q8IUF8 465 aa31.26■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP31.26■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP31.26■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NACAP1Q9BZK3 213 aa31.26■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC26Q2I0M4 334 aa31.25■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP31.25■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SZT2Q5T011 3432 aa31.25■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F5H6K3 240 aa31.24■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRDM1O75626 825 aa31.24■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BMP8BP34820 402 aa31.24■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STAT3P40763 770 aa31.24■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLRC3Q07444 240 aa31.24■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAML3Q96JK9 1138 aa31.24■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MMP19Q99542 508 aa31.24■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLIP2Q9UDT6 1046 aa31.24■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa31.23■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRBNQ96SW2 442 aa31.23■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLF1Q9BQI6 1058 aa31.23■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP31.23■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa31.22■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNM1LO00429 736 aa31.22■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFB10O96000 172 aa31.22■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COPB2P35606 906 aa31.22■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCTD2Q14681 263 aa31.22■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 REPS2Q8NFH8 660 aa31.22■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEPT4O43236 478 aa31.21■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANKRD45Q5TZF3 282 aa31.21■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAPBQ9H115 298 aa31.21■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa31.2■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARRDC4Q8NCT1 418 aa31.2■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP95Q96GE4 821 aa31.2■■■□□ 2.59
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SALL3Q9BXA9 1300 aa31.2■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PGK2P07205 417 aa31.19■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDE4BQ07343 736 aa31.19■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANO1Q5XXA6 986 aa31.19■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MKL1Q969V6 931 aa31.19■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTMR4Q9NYA4 1195 aa31.19■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYH4Q9Y623 1939 aa31.18■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TEX13BQ9BXU2 312 aa31.18■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DNAH12Q6ZR08 3092 aa31.18■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTLL1O95922 423 aa31.17■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPY3P0CV98 308 aa31.17■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPY8P0CW00 308 aa31.17■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPARAQ07869 468 aa31.17■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa31.17■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KBTBD13C9JR72 458 aa31.16■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP31.16■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF792Q3KQV3 632 aa31.16■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP31.16■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEDD1Q8NHV4 660 aa31.16■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NRBP1Q9UHY1 535 aa31.16■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLIN4Q96Q06 1357 aa31.16■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP31.15■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TINF2Q9BSI4 451 aa31.15■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZBED4O75132 1171 aa31.14■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TFAP4Q01664 338 aa31.14■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM47AQ5JRC9 791 aa31.14■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa31.14■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa31.14■■■□□ 2.58
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIFC2Q96AC6 838 aa31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms