RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440702.5

FAM20B-202, Transcript of FAM20B, glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

TSL 3

Gene FAM20B, Length 603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM20B-202ENST00000440702 OSBP2Q969R2 916 aa20.49■□□□□ 0.87
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FAM20B-202ENST00000440702 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.48■□□□□ 0.87
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FAM20B-202ENST00000440702 SNX17Q15036 470 aa20.47■□□□□ 0.87
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FAM20B-202ENST00000440702 C9orf50Q5SZB4 431 aa20.47■□□□□ 0.87
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FAM20B-202ENST00000440702 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 GPAA1O43292 621 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 APPP05067 770 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 COPB2P35606 906 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 CPXCR1Q8N123 301 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 GUCD1Q96NT3 240 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 NYAP2Q9P242 653 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.46■□□□□ 0.87
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FAM20B-202ENST00000440702 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
FAM20B-202ENST00000440702 F5H6K3 240 aa20.45■□□□□ 0.86
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