RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.46■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLFN13Q68D06 897 aa20.46■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MB21D1Q8N884 522 aa20.46■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COA7Q96BR5 231 aa20.46■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PEX10O60683 326 aa20.45■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GMCL1Q96IK5 515 aa20.45■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TTC14Q96N46 770 aa20.45■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SRRDQ9UH36 339 aa20.45■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CNMDO75829 334 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BMP3P12645 472 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAPK4P31152 587 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC1A4P43007 532 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POTEEQ6S8J3 1075 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ATG4CQ96DT6 458 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBAC1Q9BSL1 405 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXO28Q9NVF7 368 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BTBD7Q9P203 1132 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa20.44■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRKCZQ05513 592 aa20.43■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 Q3C1V9 767 aa20.43■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DGKHQ86XP1 1220 aa20.43■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NKX2-3Q8TAU0 364 aa20.43■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.43■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZSWIM5Q9P217 1185 aa20.43■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FEM1BQ9UK73 627 aa20.43■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.43■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 E7EWF7 191 aa20.42■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MCCP23508 829 aa20.42■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NCOA7Q8NI08 942 aa20.42■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RAET1EQ8TD07 263 aa20.42■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MTMR7Q9Y216 660 aa20.42■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STAT2P52630 851 aa20.41■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLS1Q14651 629 aa20.41■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF20Q5VTR2 975 aa20.41■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.41■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DCAF4Q8WV16 495 aa20.41■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SPATC1LQ9H0A9 340 aa20.41■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PORCNQ9H237 461 aa20.41■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.41■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TNKSO95271 1327 aa20.41■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM232C9JQI7 657 aa20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VWA5AO00534 786 aa20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC27A2O14975 620 aa20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FLT3LGP49771 235 aa20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC96Q2M329 555 aa20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR78Q5VTH9 848 aa20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM160B2Q86V87 743 aa20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SOCS4Q8WXH5 440 aa20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIFC2Q96AC6 838 aa20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KAT14Q9H8E8 782 aa20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GABRQQ9UN88 632 aa20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAF6LQ9Y6J9 622 aa20.4■□□□□ 0.86
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NECTIN1Q15223 517 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPR142Q7Z601 462 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLEKHH3Q7Z736 793 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A0G2JMZ2 1700 aa20.39■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYH4Q9Y623 1939 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 REC8O95072 547 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IRF5Q13568 498 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM132BQ14DG7 1078 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SART3Q15020 963 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCTD1Q719H9 257 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CYB5R4Q7L1T6 521 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NBPF11Q86T75 865 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PNMA1Q8ND90 353 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKS1AQ92625 1134 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CENPFP49454 3210 aa20.38■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERICH2A1L162 156 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLA2G6O60733 806 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZBED4O75132 1171 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FDX1P10109 184 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDHBP11177 359 aa20.37■□□□□ 0.85
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RASGRP2Q7LDG7 609 aa20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms