RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391970.3

PTPRC-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 408 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF765Q7L2R6 523 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF227Q86WZ6 799 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRC-205ENST00000391970 PRDM14Q9GZV8 571 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 FANCLQ9NW38 375 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 PRR13Q9NZ81 148 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 FBXL21Q9UKT6 434 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 LEMD3Q9Y2U8 911 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 A0A087WZG4 1122 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-205ENST00000391970 ITGAVP06756 1048 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 FAM153BP0C7A2 387 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ZNF445P59923 1031 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-205ENST00000391970 MFSD4AQ8N468 514 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 FBXL6Q8N531 539 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-205ENST00000391970 KCNH3Q9ULD8 1083 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 FHOD1Q9Y613 1164 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 GNAT3A8MTJ3 354 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 SIGLEC6O43699 453 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-205ENST00000391970 PPP2R2AP63151 447 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 TNK2Q07912 1038 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-205ENST00000391970 TMC3Q7Z5M5 1100 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-205ENST00000391970 BRF1Q92994 677 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 PPP1R14AQ96A00 147 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRC-205ENST00000391970 MRGPRX3Q96LB0 322 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-205ENST00000391970 U3KQE9 123 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRC-205ENST00000391970 SHISA3A0PJX4 238 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 GSC2O15499 205 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 TBX1O43435 398 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 PRAMEF1O95521 474 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 IGLV1-40P01703 118 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 PROCP04070 461 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 FSTP19883 344 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 OXCT1P55809 520 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 DOC2BQ14184 412 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
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PTPRC-205ENST00000391970 DUSP27Q5VZP5 1158 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 POMZP3Q6PJE2 187 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 C16orf86Q6ZW13 317 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 TRIM59Q8IWR1 403 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 FIBCD1Q8N539 461 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 SHKBP1Q8TBC3 707 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 SLC26A8Q96RN1 970 aa4.58□□□□□ -1.68
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PTPRC-205ENST00000391970 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 MKNK2Q9HBH9 465 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 AKT3Q9Y243 479 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 TRAV20A0A0B4J274 112 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 WDR64B1ANS9 1081 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 NOP56O00567 594 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CLSTN1O94985 981 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 CEACAM5P06731 702 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 SRFP11831 508 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 GRB10Q13322 594 aa4.57□□□□□ -1.68
PTPRC-205ENST00000391970 NKPD1Q17RQ9 610 aa4.57□□□□□ -1.68
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